赵坤元马上成了南明朝廷的主心骨，拜为国师，统领百官，显赫非常。世人均谓其乃是姜尚再世、伊尹重生。然其内心非常不安，更加谨慎。因他自度非是济世安邦之才，办理朝政非其所长，不过仗着道法奥妙，又有宿世影象，故能事事预知。幸亏一帮文臣效命，武将亦不敢自专，局面也渐渐安定下来。
赵坤元嘲笑道：“王铎此人只写得一笔好字，可惜是贪恐怕死之辈，并非纯臣。本日在坐诸位俱是贫道采选忠义之士，事属奥妙，还需暗中安插，勿要张扬！”
一起上太子朱慈?r满腹忧愁，冷静无言。他毕竟是个十来岁的孩子，又善于深宫妇人之手，所教诲的教员多是一帮冬烘，能有多大见地？赵坤元思来想去，策画今后明室再兴还是要靠这小我的旗号，只得耐着性子，疏导于他。
赵坤元又按着宿世的影象，将那一帮降清贰臣，渐次剥离关键权位，或以贪赃论罪，或以浮名斥逐，内里几个善能掌兵的，也峻厉警告，并派眼线时候监督。至于史可法、张慎言、高鸿图、姜曰广、刘宗周、徐石麒、瞿式耜等人天然信赖有加。还遍及网罗能臣干吏，于朝入耳用。一时候顿有复兴气象。
穆函过来禀报，问道接下来如何措置？赵坤元叫他莫急，道：“先前已令你徒弟陪着万妙仙姑来此安插，且等上半晌，自有计算！”乃焚了一道传音符咒，召许飞娘与火有害前来汇合。
不一刻，半空剑啸声起，金红剑光闪映，落下二人，恰是先前去南京的许飞娘与火有害。诸人一齐到舱中叙话。
马上传书四方，命门人弟子，齐聚扬州，又广邀同道前来助拳。这才有了一番三教斗法扬州城的后话。
清兵所占之地过于泛博，一时候感到兵力匮乏，也垂垂按住兵锋，与南明在淮河一线对峙。
许飞娘禀道：“日前来至留都，拆看掌教锦囊，按计行事。至本日方才将几家文武大臣家宅拜访结束，将来意申明，或有思疑，然俱承诺到时太子亲临必往拜见，在南京继位，身等大宝，再行北伐，报此国仇家恨！”
坤兴公主忙近前跪下道：“昔日宫中传闻有位护国真人，道法通玄，当时便有倾慕就教之心，可惜仙凡远隔，未曾得见，深觉得恨。奴虽生在帝王家，却厌倦尘凡，早有出世修行之念，因怕冲撞真人，不敢说出心中夙愿。现在真人金口亲开，怜我惨痛，弟子情愿拜在真人门下，伏请恩许！”
先前木魃穆函未与赵坤元一齐前去煤山，而是领了掌教号令，在城南运河四周觅得一艘官船，因赵坤元怕太子、公主二人孱羸，不堪高空罡气凛冽，故预先作此安排。等与穆函汇合，乃施法讳饰了形迹，沿着运河破浪而行。一起上遇着散落的宫人、婢女、官属，择其良善之辈选用在侧。
不过坤兴公主倒是很有些宇量，先前见了木魃穆函猿猴般的表面，毫不镇静，便是断了一臂，面上也毫无忧色，只悄悄端坐一旁，听赵坤元二人叙话。公然不愧是今后能成为江湖驰名的独臂神尼。
赵坤元自有火有害等人来往通报军情，乃与南明君臣商讨，请其招降李、张旧部，赦免罪恶，将满蒙鞑虏驱除中原。朝中多有大臣反对，觉得李、张俱是君父死仇，无可宽恕。赵坤元几次劝说讲授，阐发短长，最后不得已又召来崇祯帝亡魂现身，乱哄哄搅闹多日，方才了局。乃由朱慈?r颁旨，大赦天下，号令合力抗清。