清军势大，杭州不成守，很多官员再次南奔，阮大铖，朱大典亦从富阳乘周遁往婺州。
时有绝命诗一首，为幸存明兵记下，“少受父训，长荷国恩。以身就义，无愧忠贞。南都既没，犹望复兴。复兴望杳，安忍长存。卓哉吾友，虞求、广成，勿斋、绳如，悫人、蕴生。愿言从之，握手九京。人虽无死，不泯者心。修身俟命，敬励先人。”
吏部验封司员外郎华永诚，愤然曰：“内无李、赵，外无韩、岳，独一能战者王士衡，还被逼出浙，今欲为建炎、绍兴，亦不得矣！”
现在清庭兵威之盛，强于大明多矣。
中午，清兵大肆攻打杭州，总兵方国安自镇江逃脱后，手中兵马未损，另有兵近两万人，他同侄儿方元科，同清军战于湧金门下，决定降清的潞王却丧芥蒂狂地“以酒食从城上饷满兵”。
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多铎为了让明庭信赖其媾和诚意，仓促自杭州撤退，而后又自南京，起兵北返，但他回南京以后，却奥妙写动手札，令亲信送往安庆英亲王阿济格处，言：“若王士衡雄师出浙，则浙省再无大兵，可阻大清兵锋，王兄当速起大兵，马踏余杭，一战而定江南也！”
杭州城外，多铎七万雄师，无信心拿下杭州，正进退两难之际，马士英说动潞王乞降，便正中下怀。
华公死前，亦留绝命诗一首，云：“视死如归不成招，孤魂今后赴先朝。数茎白发应难没，一片赤忱岂易消！世杰有灵依海岸，天祥无计挽江潮。江山漠漠长留恨，唯有群鸥伴寥寂。”人共传之。
左懋第、黄道周等人才知潞王欲献城降清，心中非常绝望，随仓猝出了南门，正遇乘舟而逃的唐王殿下，随一同往南面而逃。
独松关一破，浙省流派大开，陈子龙守四安镇，本是防备南京清兵，却不想阿济格自西面而来。
八月五日，阿济格雄师进抵塘西，马士英见二十五万清军，连绵不断，心中惊骇，随筹办乘船出逃，却正遇方国安部下士卒前来所饷，把他从船上拖走。
摆布见此赶紧相劝，陈子龙又为夏允彝提晚诗云：“志在春秋真不愧，行成忠孝更何疑。”
刑部尚书高倬，（此君本就义于南京）得清兵入城时，以没法出城，随于家中痛骂潞藩，而后吊颈他杀。
这时清军大肆侵入浙省，不日便至杭州的动静，已经跟着夏允彝的奏报，传遍杭州，潞王顿时大惊，马士英亦是吓得口不能言。
马士英不想局势至此，心中懊悔无以复加，随挥袖而涕，却不慎坠入水中，后被方部士卒捞起，带入方国安虎帐。
陈子龙得夏允彝手札，赶紧尽起兵马，得两千余众，前去援助，行至半路，却闻独松关以破，夏允彝投水死，顿时嚎啕大哭：“今失旧友，痛杀吾也！”
清兵入城，将公锁拿，面见阿济格，公立而不跪，阿济格大怒，以脚踢其膝，公倒而又复立，阿济格随怒拔公发，直至拔尽，公自始痛骂不止，后被斩杀。
杭州城陷，无数自南直隶南下的官员和士人，与绝望中****，投水者不计其数，此中礼部郎中刘万春****死；事府少詹事、翰林院侍读学士徐汧沈投水死；光禄寺卿葛征奇投水死；户部郎刘光弼自缢死！
多铎天然不会至心乞降，他承诺和谈，却有其险恶用心，其一，王彦三万雄师入杭，他一时没法攻破杭州，恐又呈现一次扬州之围，耗花赋税兵力。其二，时至七月，江南盛暑，北兵起自关外苦寒之地，多有不适，没法久战。其三，能够媾和麻痹明庭，索要岁贡，耗其赋税，亦可借马士英之力，逐王彦出浙，使杭州一无银两，二无强兵。