洪武三年科举以后，科考轨制又停止了十余年，在这一段时候内，明朝接收文官的首要路子是由当局中已经任职的官员加以保举。但通过保举的职员人数太少，根基没法供应明帝国对于文官职员的需求，因而朱元璋又规复了科举。
陈友谅打算来一次偷袭，朱元璋则令常遇春停止在他杭州夸耀武力的活动，又令徐达前去池州，与常遇春汇合。明军两位将领结合伏击了偷袭者，活捉三千俘虏，并且常遇春杀掉了大部分人，还派了几个俘虏归去给陈友谅报信。
浙江本地被大将胡大海紧紧把握在手中，但一些苗族的非正规军开端不循分，这批军队在明军攻占浙江之前就在元军中退役，背面都集合守在金华和处州。
这一仗明军俘虏汉军海军五万人，最后朱元璋携陈友谅海兵舰队和战俘回到南京。
现在，朱元璋的军队已经靠近十万人的大关，这时候明行政机构大部分还是军事性子的。
1367年11月，朱元璋公布同时南征和北战的指令，徐达和常遇春合作带领二十五万雄师去征服北方，而胡美带军进入福建，汤和与廖永忠带海军本地岸南驰，从海长打击福建和广东。
陈友谅在九江摆设本身的水军迎战，在朱元璋飞行的途中，明军从两侧包抄汉军战线，陈友谅丧失了一百多艘大小战船，但他本身避过朱元璋的耳目，溯江而上去了武昌。
到1360年开春，朱元璋的明政权领地为江苏一部分，长江以南的全部安徽，及浙江本地部分。这些处所的总人丁在当时大抵是780万摆布。
1356年3月，朱元璋率兵攻打南京，元朝廷留在南京的戍军不敷，很难戍守。只颠末一天的苦战，朱元璋便胜利突入南都城内，南京批示官陈兆先率蒙古三万雄师投降，朱元璋将南都城由集庆改名为应天府。
陈友谅的脾气本就暴躁易怒，俘虏的陈述敏捷激愤了陈友谅，他筹算用手头的军队去击打明军，陈友谅动用了十万人，并且批示舰队向下流.行驶，他和他的舰队在1360年6月到达承平。
明汉的决斗就如许结束了，陈友谅的季子陈理被陈友谅余部张定边带走，他在逃回武昌的时候，让陈理登上帝位。
朱元璋远在长江上游，这时候苗军内部开端互通动静，筹办兵变。
1361年10月尾，南康、饶州、建昌派来使节拥戴明政权，湖北东部也有三个城池投降。
1359年11月，朱元璋亲身到金华统兵，当年12月，他建立了浙东行中书省。12月3日，胡大海自元军手中篡夺了处州。
又三个月以后，常遇春领兵占据池州。池州之捷恰是导致朱元璋与陈友谅大战的开端。
等朱元璋毁灭陈友谅班师回朝的时候，其他二流的武装盘据政权反应各有分歧，这些人包含果断和朱元璋做对的陈有定，四川的明玉珍情愿和明政权缔结友爱盟约，而方国珍则给朱元璋进贡，朱元璋在接管贡品的同时，向方国珍下发最后通牒：等明军攻占杭州，你在规定的日子内昂首称臣。
朱元璋决计迎战，他要诱陈友谅登陆，并引陈友谅去指定地点，打伏击战。等陈友谅的海军到了大胜关，这里港汊太窄，大船不能停靠，他又怕赶上埋伏，因而命令向长江返航。
朱元璋让徐达撤离武昌，他要规复和保持明军在江西已经胜利的职位，则只能让陈友谅在湖南湖北重塑他的武装。
洪武二年，朱元璋建立官学轨制，洪武三年，朱元璋重开科举测验。