此时新一轮的党争又开端了，起首是西人党卷土重来，通过他们的多番活泼，令宣祖有了重新起用西人党要员的设法，比如郑澈就出乎料想地回到了朝廷。
平壤之战结束十天后，李如松就乘胜进军，继而光复开城。朝鲜三都八道，已光复平壤、开城二都及黄海、安然、京畿、江原、咸境等五道。
反击到手的李如松把他的权势重新伸回到了朝鲜的朝廷上。这时，李舜臣在海战中带领他的龟甲船舰队获得了一次又一次的胜利，柳成龙带领的军队也立下了赫赫军功。在李如松、李德馨等人的力保之下，宣祖再次任命柳成龙为领议政。南人党的很多成员也多量获得汲引，南人党的威势再次迈向顶峰。
虽说李昖不信赖李舜臣通敌，但因为李山海节制了言路，使得情势对李舜臣非常倒霉。
次年，秀吉正式公布号令出征朝鲜，四日以内，朝鲜海防重镇釜山、东莱、梁山等地接踵沦陷。其他本地守军闻风而逃，朝鲜的海防地敏捷崩溃。登岸仅十七日，日军便兵不血刃地进入汉城。朝鲜朝廷逃到了开城。
李如松和柳成龙的联军持续向南开进，直迫汉城。固然在以后的碧蹄馆之战中明军遭到了失利，但是随后的龙山大战，明军奇袭日军的粮仓，令日军惨败。
就如许，仅两个月零两天，朝鲜三都尽失，宣祖在西人党成员郑琢的帮忙下带领朝廷众臣逃到了北方边疆义州，调派李德馨向明朝求救。
其次，朝鲜水军名将李舜臣带领的舰队多次攻击了日本舰队的补给线，立下了军功，那么保举李舜臣的柳成龙天然又获得了宝贝。
而后，西人党魁首级郑澈退场，扑灭了王储之争的导火线，也同时扑灭了东西两党决斗的导火线。
无法之下，活动在朝鲜各地的日军主力重新集结，死守汉城。至此，中朝联军与日军进入了相持阶段，而朝鲜半岛上的军事格式也趋于稳定。
明廷主战氛围高涨。明神宗命宋应昌为经略，总领抗倭事件；急调陕西总兵李如松入辽，为东征提督，团体卖力军事。明朝从天下范围集结了四万精锐。这四万军队在宋应昌和李如松的带领下，浩浩大荡地跨过了鸭绿江，开进了朝鲜。
而就在这个时候，柳成龙考虑到大局初定，不想与北人党产生大范围抵触，是以弃车保帅，没有主动禁止北人党弹劾李舜臣。李舜臣也就被灌上了“莫须有”的罪名，遭到义禁府缉捕，而元均则成为了新的三道水军节制使。
在李如松等明朝将领的支撑下，宣祖规复了柳成龙的部分官职。
正巧，储君之争给了李山海一个非常好的机遇。西人党方面，一贯是支撑仁嫔的儿子信城君为世子的，即便是郑澈本人不支撑，但碍于党派干系，郑澈必须去支撑仁嫔和信城君。李山海等人抓住了这个机遇，向郑澈和西人党建议了进犯。
而后，明军依托着火力上的上风打败了日军，逼迫行长率军逃往了汉城。
嘉靖二十四年（公元一五四五年），小尹派策动了“乙巳士祸”，肃除了大尹派的权势，订婚王后垂帘听政，与尹元衡及其老婆郑兰贞的擅权期间开端了，这也是《女人天下》的原型。
这时，行长又派人送信，称清正已登岸，朝鲜却不出水军反对，将罪恶全都算到舜臣头上。
不过，李舜臣毕竟是有过极高军功的功臣。当时朝鲜陆军大败退，只要李舜臣的水军始终没让日军占到涓滴便宜，并多次阻击了日军的火线运输线。
为了肃除勋旧派，当朴元宗等归正功臣病逝后，赵光祖等新进士林儒生走上了汗青舞台，他们被称为士林派。