安土桃山，二攻朝鲜
霸王崛起，幕府灭亡
丰臣家重臣、五推行之一的石田三成以为德川家康违背私战禁令，调集各地大名于大坂城颁发《内府违背条则》，随即起兵讨伐德川氏。德川家康则将上杉战事交给次子结城秀康，本身则带领雄师与支撑他的丰臣武将回师应对石田三成。庆长5年（1600年），两军主力最后在近江一带停止了决定今后天下情势的关原之战。
庆长3年（1598年），丰臣秀吉病逝，其季子丰臣秀赖继任家督，整日本顿时堕入混乱。自朝鲜半岛撤兵返国的丰臣氏诸将因为各自好处的题目，对以石田三成为首的五推行大表不满，乃至试图起兵暗害。另一方面，五大老之首德川家康私结诸侯，肆意分封领地，激起其他四位大老的不满。庆长4年（1599年），四位大老中最有影响力的前田利家病逝，丰臣家臣与德川家康干系敏捷恶化。庆长4年（1600年），也就是秀吉身后两年，德川家康因上杉景胜家老直江兼续的诉状《直江状》，起兵征讨上杉景胜，是为会津挞伐。
开战之初，以石田三成为本色带领（名义上的统帅则为毛利辉元）的西军守势凌厉，打得以德川家康为带领的东军喘不过气来。但是到了约莫中午时分，家康命令以火枪队向其事前已拉拢、但是在疆场上按兵不动的的西军大将小早川秀秋射击，迫使他与吉川广家等西军大将阵前背叛，直逼西军主阵。至此战况急转直下，西军从稍占上风转为完整溃败。在日落之前，这场大战便以东军大胜告终。几天后，石田三成被捕，他与小西行长以及安国寺惠琼三人作为首要战犯被处决，德川家康本色上代替了丰臣氏的政权。
永禄13年（1570年），将军足利义昭因不满织田信长疏忽幕府权威的态度，暗中与本愿寺显如、武田信玄、上杉谦信、毛利元就、浅井长政、三好三人众以及朝仓义景等大名联盟，构成所谓的“信长包抄网”，寻求结合对抗并毁灭织田信长。元龟2年（1571年），信长以比睿山延历寺包庇与其敌对之浅井、朝仓两大名，杀入山中将比睿山延暦寺焚毁，此举引来武田信玄等人之攻讦，这是信长生前引来较大争议的事件之一。元龟4年（1573年），武田信玄策动军队攻打德川家康的按照地远江国、三河国，以图进京，并在三方原之战中击败德川、织田联军。次年5月，武田信玄于信浓国驹场病故，死前决定担当人是其孙武田信胜，并由信胜之父武田胜赖担负阵代（监护人）一职。
战国期间，是日本汗青上的一个期间，简称战国，普通是指1467年的应仁之乱到安土桃山期间之间（也有把江户期间初期列入的说法）约百年政局狼籍、群雄盘据的一段期间。终究，历经超越百年的混战，德川家康在1603年景立江户幕府，而后不久再次同一天下。
室町幕府灭亡后，信长持续毁灭了浅井、朝仓两家，迫使伊势国司北田具房将家督让给信长之子北畠具豊。他还安定了三好、松永等南近畿权势。不久以后，织田信长在近江兴建安土城，作为织田政权的意味。天正3年（1575年），武田胜赖率军进犯三河长筱城，与织田、德川联军在三河设乐原展开交兵。因为织田一方利用了铁炮等新式兵器，形成武田氏折损诸多重臣。长筱之战使武田氏走向式微，导致后者于1582年灭亡。
以威慑居住此中的丰臣氏。以后，德川家康又冒充乞降，以大坂城填填埋外护城河作为和谈前提。但是在和谈停止的过程中，德川家康俄然出动数万人在一夜之间不但把外护城河填平，就连二城、三城乃至内护城河也悉数粉碎。大坂冬之阵在大坂城城防要塞完整被消弭的环境下结束。次年5月，德川家康再度出动军队讨伐大坂城，此次史称大坂夏之阵的战役终究攻陷大坂城，秀赖母子他杀，与老婆德川氏（秀忠女，家康孙女）所生季子国松亦遭斩。通过大坂冬、夏之阵，德川家康完整毁灭了丰臣氏权势，结束了自应仁之乱以来混乱的战国局面。