礼部承担的职司不便，还是礼乐之事、科举之事和涉外之事，三娘特别减轻了理藩院的职责，并规定此后前来朝拜的藩属之国，在行礼之时，定是要公允买卖，三娘可不是那些抱着天朝上国的思惟，别国进贡一些土特产，然后天朝上国为了面子题目，就赐下一些丝绸、茶叶、瓷器等等，每次朝贡行礼都是亏蚀的。
扈岚得承帝位，诏命群臣，建号大元，定都燕京为中京，仿宋例定五京，以会宁府为北京，开封为南京，山东济州府本身起家之地为东京，山西太原府为西京。三娘定五京，初次有关外州府为京，又将都城定在燕京，显现了她想要节制北地，完整断绝来自漠北游牧族的威胁。
枢密院内还设参谋部、谍报司、水兵部三个关键部分。参谋部便是枢密院评价周边诸国气力，推演与假想敌作战方略，制定各种作战打算，编练天下军马之地。谍报司顾名思义便是汇集谍报的处所，谍报司是侧重军事谍报汇集，处于明面上的谍报机构，而锦衣卫始终是三娘亲身掌管的大内幕报机构，二者互不堆叠。水兵部便是掌管天下水兵的部分，编练天下水兵、内河水军，沿岸、沿河防务都属这个部分。
户部主管天下赋税、人丁口数、农田地盘数量、各军甲器、各种牲口数量等，总之户部不但承担了后代统计局的差事，还兼着渔业部和农业部的差事。本来三娘想要一次性把后勤部和农业部伶仃剥离出来，但总感觉一下子搞出八部来也过分烦琐，还是精简些机构较好，是以在户部下设了渔业司和农林司。
六部官员和属员多数是由山东路出身的文官担负，他们在山东路实施的新政已经有了很好的经历，接下来只是推行天下的题目罢了。而梁山出身的老兄弟中，只因很多都是武将出身，是以在六部担负官职的并未几，只要穆弘为兵部尚书，韩韬、彭玘、黄信、孙立等人在兵部任侍郎，铁面孔目裴宣为刑部尚书，蔡福、蔡庆在刑部任职，九尾龟陶宗旺在户部农林司任职，孟康在船舶司任职，汤隆在兵甲司任职，金大坚、萧让在礼部任职。
凡分受官员禀奏，吏部主管封赏以外，还要管各地官吏的任免、官吏的年绩核考、官吏升迁降职等事件。与宋制分歧的是，三娘将各州县小吏也定了品级，正式归入官员体系，也普通的有升迁调剂，而不是像宋朝那样，小吏永久只是小吏，干了几十年还是一个小吏，并且小吏也能通过考核正式升任官员，只不过考核的内容比较变态，难度很高，除了在任时候的政绩以外，还要有一技之长，然后是严格的测验，测验题目天然是近似后代的公事员测验，只不过扈元朝的公事员测验更重视合用。
本来群臣大多都反对迁都燕京的，启事很简朴，燕京那边人丁太少，水运漕运也不及开封便当，实在不是帝都的首选，但三娘还是力排众议，定下便在次年迁都，便另有一年光阴筹办。
其他梁山老兄弟都是武将出身，三娘在天下设立了东西南北中五雄师区，卖力统领天下兵马，卖力戍边和保卫处所。其他梁山武将及田虎、方腊麾降落将都在五雄师区以内担负军职，其间就不一一赘述。总之三娘为跟从本身的一干老兄弟都安排好了，除了担负军职以外，三十六天罡正将都按军功封了侯爵或伯爵之位，其他将佐或封男爵、子爵，都有爵位封赏。
而兵部此次官制变动最惹人谛视标就是兵部之下设立的兵甲司和后勤司，这两个司部承担的职责便是把各军统军将领手中的权力剥了过来，赋税甲器一应军中所需此后由户部这两个司承担，就不再是一军将领掌控全军的赋税甲器了。这也是三娘早早的把制止部下将领坐大的手腕使了出来，只要节制住一军的赋税甲器命脉，再强的将领也不能掀起甚么风波来，这也意味着三娘对天下军队的节制更加松散了，此后军队便是国度的军队而不是哪一个将领的军队了。