帝奄不救疾，胤嗣未建，琅琊王丕，复兴正统，明德懋亲，昔在咸康，属当储贰，以年在幼冲，未堪国难，故显宗高让。今义望情地，莫与为比，其以王奉大统，毋坠厥命！这令下后，当由百官备齐法驾，至琅琊王第迎丕入宫，升殿即位，是为哀帝。丕时年二十有二，曾纳司徒左长史王濛女为妃，至是册为皇后。封弟奕为琅琊王，奉葬穆帝于永平陵，庙号孝宗。尊所生母周氏为皇太妃，穆帝后何氏为穆皇后，又诏谕中外道：
恪得闻根言，知根必将为乱，乃与太傅评联名，密陈根罪，即便右卫将军傅颜，引兵至内省诛根，并拘根老婆党与下狱，酌正法刑。中外未悉详情，还疑燕廷骤诛大臣，不免惊诧。恪独平静逾恒，毫不镇静，每有出入，只令一人步从，或劝恪宜自防备。恪答说道：“情面方思疑贰，非静镇不敷安众，怎得自相惊扰呢？”公然不到数日，民气复定。惟各郡县所征兵士，乍闻大丧，并有内哄讹传，常常乘间散归，自邺以南，路人拥堵，几至断塞。恪授垂为镇南将军，都督河南诸军事，领兖州牧，兼荆州刺史，出镇蠡台。又令孙希为并州刺史，傅颜为护军将军，带领骑士二万，观兵河南，临淮而还。因而天下兵民，各知朝内无事，相率安堵，不复活疑了。如恪才为社稷臣。