过了几日，宁王朱权率诸王及群臣劝谏朱棣：“国不成一日无君，建文帝受奸人勾引葬身火海，二位嫡出皇子又下落不明。诸王当中，只要燕王殿下春秋最长，声望最高。请殿下为大明江山社稷着想，即位为帝。”朱棣故作推委：“本王奉天靖难，只为断根君侧，待擒获黄子澄、齐泰等奸臣，本王便出兵而还。”诸王及群臣又再劝谏：“请殿下为大明江山社稷着想，殿下为太祖高天子与孝慈高皇后嫡子，理应挽大明于危难。请殿下先即位再除奸臣。”宁王朱权及群臣苦苦劝进四天，朱棣终究承诺即位为帝，随即派人到北平接来了燕王府中的亲眷。
驻守在龙江的朱棣，突见奉天殿方向起火，赶快率军入宫，魏国公徐辉祖率军抵当，徐辉祖不敌，败下阵来。徐辉祖痛哭流涕：“太祖天子，江山就要易主了，臣故意抗燕，却已有力回天，臣对不起太祖天子。”徐辉祖哭罢，单独一人去了父祠，直至朱棣即位为帝，徐辉祖都在父祠当中不肯出来谒拜朱棣，朱棣一怒之下将徐辉祖关押在了天牢，幸有令仪为本身的长兄讨情，才令其返回私宅，得以善终。
朱棣行至孝陵，走进享殿，环顾着享殿中的牌位，见这享殿里仍然没有本身生母碽妃的牌位。朱棣走到朱元璋的牌位前，跪倒在地，眼泪直落：“父皇，老四来了。老四又跪在您的牌位前了，多少次，老四都觉得此生再也没有如许的机遇了。父皇，老四总算能与父皇好生畅谈一番。父皇可知老四这久治不愈的咳疾与风湿之症便是当年北征之时所患？父皇你过分偏疼，老四自小落空生母，又不得父皇垂爱。这四十年来老四受人欺负，忍气吞声。秦、晋二王欺负我兄弟，老四各式哑忍；建文削藩，老四佯装痴颠；疆场之上，老四冒死拼杀，几番几乎丢了性命。可老四从未认输，总有一天老四要让父皇看到，若无皇四子燕王棣便无大明海清河晏之盛景，若无碽妃便无大明承平乱世之基业。现在，天位已虚，诸王群臣再三劝进，老四不能置父皇基业于不顾，不能置天下生民于不顾，老四就要即位为帝了，父皇放心，老四定学父皇为政勤恳，励精图治，把这大明江山管理好。另有，老四晓得父皇是爱母妃的，这么多年来，父皇与母妃生亦分袂，死亦分袂，苦了父皇、也苦了母妃。待老四即位为帝，老四便将母妃的牌位放在这享殿中，让母妃伴随父皇。”说毕，朱棣站起家来，走到享殿的门口，朱棣又回转过身来，“老四不会让父皇绝望的，父皇此生未完成的，老四替父皇完成，多年以后，老四会给父皇缔造一个海清河晏的大明乱世。”朱棣说完，便分开了享殿，跨上战马，直奔皇宫。
听到被诛十族的动静，方孝孺的老婆郑氏脾气刚烈，不待燕军来到府上，便与方孝孺的两个儿子方中宪、方中愈自缢而亡，方孝孺的两个女儿来到秦淮河边，跳河他杀。方孝孺其他亲人及门放门生共八百七十三人被押赴聚宝门。
眼睁睁地看着本身的亲人被砍下头颅，方孝孺声泪俱下。方孝孺的弟弟方孝友见兄长抽泣，开口劝道，“哥哥不必哀痛，父亲在时便常对你我说，人活活着，要‘仰不愧于天，俯不怍于人。’我方家世代贤能，忠君报国。现在满门忠烈，先祖足当含笑地府。”方孝孺扭头看着方孝友，眼泪倒是止不住，哽咽着说道：“殉身大明、尽忠陛下，我百死何憾？只是苦了你们。”方孝友微微一笑，对着方孝孺吟了一首绝命诗：“阿兄何必泪潸潸，取义成仁在其间。华表柱头千载后，旅魂还是到家山。”方孝孺听了方孝友的这首诗，闭上了双目，也吟了一首绝命诗：“天降乱离兮孰知其由，奸臣得计兮谋国用犹。忠臣发奋兮血泪交换，以此殉君兮抑又何求？鸣呼哀哉兮庶不我尤！”如此，千古忠臣方孝孺为建文帝尽忠，时年四十六岁，其十族被朱棣诛杀。