为了筹办这场水战，淀川光长早早的整队水军，并在接下来的几天时候里，慢慢减少迎击织田水军的船，每次打跑织田水军也不追击，而是调转船头返回坂本港休整，几天下来坂本水军反击的数量越来越少，渐渐的织田水军能够获得船只上的绝对上风，坂本水军开端挑选后撤避战的态度。
犒赏织田信长従三位参议还不敷，足利义昭又给织田信长加了一个名份，封织田信长为副将军，其子织田信忠为従五位下侍从，并享用三管领家格，织田家一系的军人个个受封，柴田胜家晋升従五位下补缀亮。丹羽长秀晋升従五位下越前守，就连献策有功的木下秀吉也遭到封赏，晋升従五位下筑前守，并改名为羽柴秀吉。
跟着坂本港被封闭多日百业冷落贩子远遁劈面的小滨，逃逸的民船也越来越多导致可控御使的小早严峻不敷，以是坂本水军出动的船队越来越少，这就是眼下最好的一次机遇，哪怕这个机遇存在庞大的伤害，他也要赌一把。赌赢了立名立万，赌输了仿佛也不会有太大的丧失。
总之为捞取首功也想在幕府露个脸，九鬼嘉隆决计罢休一搏，在他看来八万雄师四周八方的围住坂本，此时这座畿内名城早已是瓮中之鳖，即便他所带领的织田水军被打败一场也不会如何，这些日子里接连受挫又不是一次两次，遵还是例只要谨慎谨慎、脑筋矫捷，即便再输也不会输的多惨。
男女长幼齐上阵，阵容不小却质量不敷，几百面分歧灯号的混乱旗号顶风招展，几近每艘船都有自家的名号，这整齐不齐绝对让人晃眼，九鬼嘉隆才不管这些人到底如何样，只要声望够大就充足了，坂本水军出动最多的时候也不过三百余艘舟船，更何况现在就一百多艘船守着港口，那还不是分分钟就处理的小事。
这类环境下，新天皇就变成彻头彻尾的傀儡。好歹之前另有点权力写个诏令派个大臣去化化缘，或者派出清华家、大臣家的公卿到远国找各地大名领主构和，你们占的庄园之前是天皇家的御料所，朝廷刻薄也不筹算要回那些庄园，但是如何也得给朝廷点御料钱。
这六百余艘船的成员构成比较庞大，此中有部分来自伊势、尾张、纪伊，乃至美浓川并众，更大的一部分是离开坂本水军配下的琵琶湖小股水军众，在淀川光长配下混的不太好的淀川小股水军众，夙来不太理睬淀川水军众的木津川水军众等大杂烩调集在一起。
这场大乱被称作永禄禁中之变，足利义昭伙同织田信长一党，在正旦大朝会的当天突袭大内里，将百官囚于宫中不得脱身，强令阃亲町天皇写下退位圣旨，而后簇拥着年青的诚仁亲王走上皇位，足利义昭与二条晴良全程立于摆布，而织田信长更是趾高气昂的仗剑入宫，其高傲的架式不下当年鼎盛期间的平清盛一族。
九鬼嘉隆本身感觉已经把握坂本水军的实际环境，垂垂的不再利用捕掳民船作为前驱的战术，这类粉碎贸易公允的行动一向被正视贸易的织田信长峻厉制止，若非此次围攻坂本的军事行动非常严峻，织田信长也不会例外让九鬼嘉隆用这么得不偿失的战术，在答应利用的同时还对他的警告，能罕用一天还是尽量罕用一天。
永禄十二年正月十八日，恰是禁中之变结束的半个月，织田信长堆积畿内四方之军势共八万人向坂本城建议打击，正急红眼要争功的浅井长政、朝仓义景所部两万军势充当前锋，对伊香郡展开进犯，如饥饿的狼犬扑食猎物贪婪而残暴，中条时秀见势不妙立即收紧军势烧毁城砦，雄师退回相对安然的高岛郡持续笼城。