1587年，在外流落流落多年的足利义昭受丰臣秀吉恩赐获得了安居之所，但是一年后的春季，这位名存实亡的幕府将军再次削发。1597年8月28日，足利义昭病死于大阪，享年61岁。
1568年，织田信长带领雄师，一起过关斩将，顺利攻入京都，松永久秀投降。进入京都后，织田信长做的第一件事就是拔除了由松永久秀所立的幕府将军足利义荣，并于10月18日拔擢足利义昭为室町幕府第15代征夷大将军。
叛军头领松永久秀见此景象，急命由他亲身练习的洋枪队射杀足利义辉，这位身中数枪的幕府将军在奋力斩杀了数名敌军后，倒地而亡，时年30岁。足利义辉身后，松永久秀拥安身利义辉的堂弟足利义荣继任为室町幕府的第14代将军，但真正应当具有将军担当权的是正在兴福寺削发的足利义辉的亲弟足利觉庆。
足利义辉曾经向新阴流鼻祖上泉信纲和新当流开山祖师冢原卜传两大剑术大师学习过剑法，剑技高深，技艺高强，被世人誉为剑豪将军，部下侍卫个个勇猛善战，加上逢此存亡存亡之时，更是极力死战，以一当百，将来犯之敌一一斩杀，使敌军没法近身。
本应如先人般干一番轰轰烈烈奇迹的足利义昭，虽名义上为室町幕府的第15代征夷大将军，却到处受制于人，因此，他规复家属曾经光辉的胡想，只能依托在别人身上。不管是六角承祯、武田信丰和朝仓义景等决然回绝他的大名，还是大要承诺帮忙他的织田信长，终归都是外人，都没法遵循贰心中所希冀地那样去做。更何况，此中还包含着权力与好处的胶葛。这统统，都必定了室町幕府的光辉一去不复返了，而足利义昭便顺理成章地成了室町幕府最后的将军。
坐上大将军之位的足利义昭觉得自此今后本身就能号令天下，但是很快他发明，事情的生长并没有设想中那么顺利。他的行动到处遭到织田信长的束缚，没法利用将军的权力，本身的处境与傀儡无异。为了早日摆脱这一景况，足利义昭大要对织田信长言听计从，公开里却以大将军的身份奥妙联络了武田信玄、浅井长政、朝仓孝景等反织田信长权势，筹办合力颠覆织田信长，这就是所谓的“织田包抄网”。但“织田包抄网”很快被织田信长崩溃，势单力薄的足利义昭没法抵挡织田信长的守势，虽有正亲町天皇居中补救，但是足利义昭和织田信长的分裂就此必定。
在殛毙足利义辉后，松永久秀本想趁便将足利觉庆一起撤除，但因为兴福寺具有极其强大的僧侣武装，松永久秀的诡计没法得逞。固然足利觉庆保住了性命，但是他的一举一动遭到松永久秀的周到监督。1565年7月18日，忠于室町幕府的细川藤孝冒着灭族的伤害将足利觉庆从兴福寺救出，藏匿于南近江六角氏家臣甲贺和田惟政家中，足利觉庆此时出家改名为义秋。但是没等喘气多久，足利义秋跟着细川藤孝又开端了流亡糊口。其前后投奔过六角承祯、武田信丰和朝仓义景等有力大名，但愿重振幕府雄风，但是都遭到了这三家大名的回绝。
甲胄入库今后是歌舞升平，全盛期间过后是满目疮痍。作为室町幕府第15代征夷大将军，足利义昭应当很想再回到畴前那段波澜壮阔。幕府把持天下的名胜当中去。只可惜，好梦不常有，好花不常开，实际带给这个运气不济的幕府将军的是一次次的绝望和感喟。更加可悲的是，他的绝望和感喟老是遭到各地保护大名的嘲笑和捉弄。在被强权人物几次称为“窘蹙公方”之前，足利义昭的终究运气早已必定下了。