至此，因皖南事情引发之两党全面对抗局面，起码在情势上算是告一段落了。虽但是后中共一度又提到新四军题目，但仍只限于要求同意整编其“余部”及赐与经费方面，再未提出打消蒋令及开释统统职员枪弹等题目。
一样，畴前述毛泽东主席对蒋介石的判定，和中共中心所作出的有关决定看，中共方面对与百姓党朴拙合作，也不再抱有任何胡想。因而，皖南事情天然成了抗战期间国共干系逆转的一道分水岭。事情前，中共军队固然已经在独立批示、自行生长，但它仍旧附属于百姓当局之下，起码名义上仍随时呈报并请领军费弥补，情势上仍旧利用着同一的货币和遵循着同一的政令法律。国共之间军事上的摩擦抵触也仍可通过普通路子反应或协商。是以蒋之号令或要求，普通总还具有必然的束缚力。事情以后，百姓当局断绝对中共军队的统统供授予弥补，堵截了本身与中共军队的统统干系，成果反使本身威望扫地。中共政权与军队今后断绝与百姓当局之间的统统上下级干系，自设银行，自发货币，自定法规法律，自行其事，完整离开百姓当局而自行存在，蒋也落空统统号令之权。今后调和两党干系之困难，也便可想而知了。
蒋介石在参政会上的报告和毛泽东随后的唆使，再清楚不过地表白国共两党这时都在设法和缓。而尤其惹人谛视标是，毛前此所说的以半年为期“处理善后前提”，中间盘子已由两个十二条，减少到同意扩编军队、保持现有防地、包管《新华日报》普通发行，和不得在收支边区的交通线上随便捕人这四点。因为避开了蒋介石极其敏感的皖南事情善后及17日令等题目，两边之间的谈判较着地变得轻易了很多。14日，蒋介石与周恩来的说话中，也不再提起中共军队北移题目了，明白讲：“只要听号令，统统都好说，军队多点，饷要多点，好说”。至于不得压迫《新华日报》，以及开释前此截留的进入边区的中共有关职员和发放通行护照等事，蒋都满口承诺下来。据此，周提出：可否先处理这些小题目？毛当即表示同意。至4月26日，毛更明白唆使周恩来讲：能够向蒋“表示我党情愿同百姓党持续连合抗日，惟望百姓党窜改对内政策，并对八路发饷，公道处理新四军题目。”
不过，皖南事情所引发的国共党干系的严峻窜改，却不是两党情势上的这类让步所能消弥的。百姓党固然不顾统统地毁灭了7000新四军并宣布撤消了它的番号，但新四军还是存在，并且所占地区及兵力更加扩大与强大，其在新四军范围内的百姓党军队反而一一被摈除或毁灭，百姓党实在一无所得。更加首要的是，皖南事情底子分裂了两党之间的豪情联络。从蒋介石在参政会密示百姓党参政员国共必然要分裂，和百姓党军委会办公厅3月18日公布的改“某党”为“奸党”令等究竟看，百姓党在事情后明显已经正式决定把中共视同“汉奸”，情势答应时必欲“剿除”。
5月日军打击中条山，蒋介石要求八路军出动共同作战，非论八路军终究是否停止了共同，中共中心唆使八路军加以共同仍属究竟。至11月参政会二届二次集会召开之际，中共方面乃至更将前提降落到只要“放叶发饷”做到一件便可插手。最后，百姓党一件未做，中共衡量利弊还是派董必武和邓颖超插手了此次集会。这意味着，皖南事情之“善后”事情已不复存在，国共两党因为事情所引发的分裂伤害，业已消弥于无形当中