会后，蒋介石对他不对劲的第三战区停止了人事调剂，实际上只是调了一小我，那就是冯玉祥，他被调到新建立的第六战区去当司令长官去了。第三战区司令长官的职务由蒋介石本人兼任，顾祝同仍为副司令长官。蒋介石这么做，有他的考虑：一是跟着战事深切，两边都在不竭增兵，范围另有持续进级的势头，由本身亲身担负第三战区长官，足以向外定义明他正视的程度；二是让冯玉祥批示并不是其部下的中心军和各个杂牌军构成的火线军队，明显不能得心应手，而第六战区在北方，那边多为冯的旧部，批示起来比较轻易。不过冯的确跟蒋合不来也是一个首要究竟，冯玉祥不满本身被闲置，老是发牢骚说怪话，也招惹了蒋介石的极大不痛快。传闻白崇禧也对冯看不过眼，白当时担负副总参谋长，来往京沪之间观察，见其每天不睬火线战事，尽管”作诗骂人、不务正业、不干闲事”，返来向蒋介石作了汇报，建议调走冯玉祥。冯与蒋的冲突和隔阂自此进一步加深，抗战胜利后，冯对蒋热中打内战和对抗日公众的倒行逆实施为极其气愤，公开反蒋，蒋介石命令辞退冯玉祥的军籍、党籍和公职，两人完整分裂，这是后话。
抗战期间，在抗日救国的旗号之下，冯玉祥与蒋介石干系团体是较为和缓的，冯从命蒋的带领，蒋尊敬冯的定见。在民族危亡关头，冯玉祥对蒋介石做了三件事：不竭鼓励蒋果断抗战决计；重视保护蒋的魁首职位和庄严；也勇于攻讦蒋的不敷。
但偶然蒋介石的某些政策和做法也实在是让人看不畴昔，冯玉祥也会停止劝谏和攻讦。冯对蒋的集权多有攻讦，他在日记里写道：“蒋先生但是国度的魁首，甚么都是一人兼任，一小我便是全能，也不能兼顾万处，这甚么都管的主义叫甚么都不管。”冯玉祥因之专门给蒋写信建议：“请设智囊团及专门人才研讨团，因一人的精力有限，如果有要事待商，可请智囊团研讨插手定见，专门人才之设专为科学之会商，如火线坦克车之如何破法，计谋上之题目皆可付与研讨。”冯觉得罗斯福、斯大林以是能有大成绩，与实施此建议有直接干系，故望蒋能以此项建议为当务之急。
周恩来曾奖饰冯玉祥有“为人所不敢为，说人所不敢说”的精力。冯玉祥也把这类精力用在蒋介石身上，蒋的文胆和谋士陈布雷说过蒋的“人才与资望”决再找不出来，这个批评就当时的人看来，是并无多少夸大的，冯玉祥对蒋也是非常景仰的，他写道：“以蒋先生之夙兴夜寐，整天勤奋，吾人回无懈可击。”
抗战不久，冯玉祥被召回武汉。中心练习团，冯玉祥受邀演讲《甚么是你的胜利》，讲了约4个小时，意义是说中华民国的胜利就是你的胜利，蒋先生的胜利就是国度的胜利。冯玉祥把蒋介石的成败与中华民国之运气视为一体。冯如许讲，当然也令蒋介石非常对劲。
在冯玉祥任第六战区司令长官时，一天，西北军将领冯治安、陈继淹同萧振瀛来桑园看望，言谈之下，萧振瀛说当局对不起他们，冯玉祥顿时说：“当局现在抗日，不管是谁，不能再说当局不对。”并实在地反复了一次，还特别叮咛冯治安，不管如何，不能受人教唆，说当局的不对。