（濂洛关闽：濂指周敦颐的理学、洛指程颐的洛学、关指张载的关学、闽指朱熹的闽学。）
叶向高在上书中称‘自国初设科罗才，虽取词翰，而学宫功令载在卧碑者，一本于德兴，至以明伦额其堂，其大指与三代同，而末流之弊，逐功利而迷本真，乃反甚于汉唐。圣贤以是教人之法具存于经，贤士大夫欲起而维之，不得不复修濂洛关闽之余业，书院讲会使好学之士可质疑答辩，令人知所自往，岂谓谋逆耶’。
顾宪成重新补葺东林书院后，为其撰写的名联“风声雨声读书声声声入耳，家事国事天下事事事在心”说出了读书民气声，以是‘朝士慕其风者，多遥呼应和’。
刘一燝、韩爌等在大殿细数书院的各种好处，将孙如游、方从哲问的几近哑口无言，朱由校看着他们唇枪激辩，不由莞尔。
聪明如你必然能看出这便是‘不法集会’，不言而喻，这类书院带有较着的政治偏向，去肄业者也有企图博取讲官的赏识，达到高中或加官进爵的功利目标。
“髯中间，按祖制，凡在野贤人、有志懦夫、朴素农夫、商贾技艺皆可经通政使司具名奏陈官方利病，何来梗阻？任贤荐能、严厉朝廷律令乃内阁及各部本职，岂能任由心胸不轨者聚众指手画脚、勾引民气？”
东林书院的实学以时政为讲学课本，在讲习之余，招四方游士与相讲论，公议朝政得失，裁量人物。
官学传授朱程理学，按地区可分为两京的国子监（有太学，但文献中常混为一谈，存疑）、内书堂（教诲年幼内侍，属司礼监）、宗学（教诲宗室后辈，设在各地王府），处所又有府、州、县、卫、都司、土司等黉舍。别的，另有教诲孔、颜、孟、曾氏（曾氏为万历十五年所加）贤人子孙的四氏学。
朱由校没想到一篇文章引发朝野如此大的反应，因而专门同各部体味当下的教诲状况。
内阁为此也争辩不已，方从哲、孙如游同意严禁书院、，韩爌、刘一燝反对称‘官学陵夷，书院为辅，名流弦诵其间，而风教始著，应搀扶，以抖擞鼓励天下士气’。
“皇上，生员不过以根究实事，辨明真伪，并非谋逆。”
垂垂的，这类讲会便跳出了学术范围、离开书院形制，靠近社会演讲，加上参与讲会的大儒不时退隐，居官论政，使得东林可遥制朝权、挟制边镇、把持处统统司，从奥妙重权到诉讼小事，无不干预。
孙承宗看不过眼，代为解释道，“世庙曾下旨‘书院应建立者，必须请旨，教官生员悉令于本处肄业，不准刊刻册本、刷印送人，糜费民财’，故《京报》所载并无弊端，朝野世人夸大其词。”
但什物都有两面性，因王湛心学的门徒对师说了解不一，相互纷争，更有甚者徒尚空谈，‘守仁倡知己为学者，久益敝…有以纵恣为天然者’，‘士之浮诞不逞’。
正如叶向高疏中所言，科举的招考教诲使得读书人思惟监禁，只知追逐功名，使得教诲落空本来意义而成为科举的附庸，以是有识之士为挽救这一弊政而创建了书院。
社学即为朝廷‘为训童蒙’准官方创办的半官方性子的小学。如规定‘乡里凡三十五家皆立一社学，以生员、儒士为师，凡愿读书者，尽得预焉’。社学因是州府县学的预备黉舍，以是朝廷指正视，在成化年间杨继宗在嘉兴任知府时，更是规定‘官方后辈八岁不就学者，罚其父兄’。
这还是因为当下没有正式的表达民意的议政构造，书院便自但是然的代行权柄，以期制造言论，干与朝政。