“……”世人皆沉默以对。
内阁为此也争辩不已，方从哲、孙如游同意严禁书院、，韩爌、刘一燝反对称‘官学陵夷，书院为辅，名流弦诵其间，而风教始著，应搀扶，以抖擞鼓励天下士气’。
终明一代，天下书院有大小1200余所，以江西（287所）、浙江（199所）、广东（156所）、河南（112所）为众，此中民办184所，占15%；官办（包含处所官、督抚、京官等）828所，占60%以上；别的另有家属书院等。
本来，自《京报》创刊号中的《私开书院讲学=谋逆》一文广为传播以来，便持续发酵，会极门每天收到的在京官员及通政司转来的各地上书少则五六十，多则上百，堆集到现在已有上千封。其内容大同小异，都要求严惩撰文者钱象坤，称其祸乱朝纲，用心叵测，并要求停刊、严惩幕后教唆。
禁毁书院在这之前有两次，一在嘉靖十七年，一在万历七年，但因书院有会商学术、传播思惟的本质，两次都不完整。
朱由校在获知赋闲在故乡福建福清的叶向高（1608-1614为首辅）不远千里上书后，便晓得本身拿书院带刀有些过早，有些悔怨。
世人相互示之以目，内心皆一个心机：立光庙为储离不开天下士人的援助，今上登极也离不开顾命大臣及东林杨涟及左光斗等人大力支撑，现在天子此举，不异于‘飞鸟尽，良弓藏’，有卸磨杀驴之嫌。
东林书院的实学以时政为讲学课本，在讲习之余，招四方游士与相讲论，公议朝政得失，裁量人物。
孙承宗看不过眼，代为解释道，“世庙曾下旨‘书院应建立者，必须请旨，教官生员悉令于本处肄业，不准刊刻册本、刷印送人，糜费民财’，故《京报》所载并无弊端，朝野世人夸大其词。”