第三部该部于1937年8月20日建立。先为掌财务金融，后改掌国防产业。8月20日任命孔祥熙为部长。9月11日任命翁文灏为部长，钱昌照、俞大维为副部长.1938年1月该部归并于经济部及其地有关各部。
抗日战役初期百姓党大本营体系
1938年2月9日免唐生智总监职，以鹿钟麟任之.是年6月14日鹿钟麟他调，以何成浚任总监。1940年12月秦德纯代理副监，1942年10月实任。1941年1月免除谷正伦副监职，贺国光继任副监。
4、军训部
侍从室的构造,除原已建立的各处、组外，1938年在武汉又建立了第六组，附属第二处，同时也受第一处带领，综理统统特工构造的谍报停业，派唐纵任组长。
7、政治部
委员会构造纲领》规定，军事委员会为战时统辖天下军民作战，直隶gm当局；军事委员会委员长率领天下陆海空军，并批示全民，负国防之全责。军事委员会设委员7—9人，由中心政治委员会选定，由gm当局特任之。别的，参谋总长、副参谋总长，军令部、军政部、军训部、政治部4部部长及军事参议院院长为当然委员，委员之职责为赞襄委员长筹划国防用兵大计。1月15日gm当局重新任命阎锡山、冯玉祥、李宗仁、程潜、陈绍宽、李济深为军事委员会委员：按照《修改军事委员会构造纲领》规定，参谋总长何应钦、副参谋总长白崇禧、军令部部长徐永昌、军政部部长何应钦，军训部部长白崇禧、政治部部长陈诚、军事参议院院长陈调元为当然委员。
3、军令部
军法履行总监部，掌理军队规律之保持与军法履行事件.该部下分总务、审判和督察3个组：总务组，掌理该部文电收发．承办文书典守印信、编审预算及经费出纳并碎务和官兵起落开补功过、奖惩告假旷职等各项事项。审判组，并军政部军法司而建立，掌甲士犯法案件考核事项；非甲士犯汉奸、烟毒、盗匪、贪污及其他法律应归军法审判案件之审理、考核事项；关于军法法规检查事项；关于解答法律疑问事项；关于军事犯措置事项；关于该组禁闭人犯收管、戒保护生登记、访问查抄册本函件各事项；关于军法行政事项。督察组，掌前火线文武构造职员违背军事法律之事项；关于考查各级司令部军法处有无枉纵事项；关于消查各地汉奸活动加以制裁事项；关于考查军情战况、交通运输、防空保镳、救保护生及公众构造练习各事项.
侍从室第一处，主任钱大钧。钱于1938年3月调任航空委员会主任，林蔚接任主任。同时，陈希曾接莫我若任第一组组长。兼侍卫长钱大钧调离后，侍卫长一职空缺，王世和接陈善周任第三组组长，并代理副侍卫长：
1、军事委员会
1937年12月13日南京沦亡后．gm当局迁至武汉；1938年1月17日军事委员会又停止改组，将党政军分开。《修改军事
按照军令部构造法，该部下辖工兵批示部、炮兵批示部、通信兵批示部、战史编辑委员会，通信总所、技术室、各省测量局、各种测量队、陆军大学暨参谋班、中心陆地测量黉舍暨分校、边务研讨所、重庆核心阵地参谋团、特种兵器尝试组、通信职员练习班、谍报参谋练习班等。工兵批示部掌普通工兵的利用打算与作战指导，独立工兵的批示；工兵军队的编组、整补、练习、考核：工兵技术的设想改进；预备阵地的窥伺、永久工事位置的算勘及功课指导等事件.炮兵批示部掌各战区有关炮兵的利用打算及考核各炮兵军队的战役批示、整补、练习等事件.通信兵批示部掌统统通信兵利用的打算与指导；通信兵的调查分拨；研讨关于通信兵的利用对策及技术设想等事件.战史编辑委员会掌战史的编辑及编译事件。各省测量局掌各省测量及其行政事件：各种测量队掌测量事件.陆军大学掌高档军事教诲,中心测量黉舍掌测量教诲：边务研讨所掌边务教诲。重庆核心阵地参谋团掌重庆核心工事的打算并监督实在施事件。特种兵器尝试组掌水雷及江湖梗阻兵器的研讨事件。通信职员练习班掌谍报通信教诲。谍报参谋练习班掌谍报参谋教诲。