后，世民与建成元吉，日发反目。东西两宫到处有隔。三子如箭在弦，立破只一时罢了。
是年六月初四庚申日（公元626年7月2日），唐高祖李渊次子秦王，率长孙无忌、尉迟敬德、房玄龄、杜如晦、宇文士及、高士廉、侯君集、程知节、秦琼、段志玄、屈突通、张士贵、公孙武达、独孤彦云、杜君绰、郑仁泰、李孟尝诸将整兵待入。秦王妃闻知，亲着朝服至诸将士前，以平昭阳公主昔年所赠之刃为誓：如事不成，当以其身殉义。如事成，将以身保诸将一世无忧。
武德九年初，世民得太子府中侍婢报，言建成曾于暗里叹今上不明，当日竟将命定中宫之女适于世民。言辞之间，似有恨意。世民大怒。
另有其他诸妃，均得封赐。众妃佩服，皆今后长孙氏为表。
世民力排无忌异，收魏征。
武德九年蒲月末，万妃因闻尹张二妃私藏贡品事，着贴身侍婢暗查尹氏张氏之宫中事，不料竟得其与太子建成欲谋世民之私信，与元吉**后内之物证。
世民泣，请高祖务以此为念，道：“世民未成储，已然欲杀之。现在太白星现，兄长岂能容我？”
燕氏女丽容为贤妃，赐宫室。
六月十二，高祖命宇文士及为太子詹事，长孙无忌杜如晦左庶子，高士廉房玄龄右庶子，同助太子世民。
不料父子之言，为张氏身边近侍得知，急报张氏。张氏大惊，乃召尹氏、元吉、建成密议，欲除世民而逼宫。
封韦氏女珪为贵妃，其堂妹尼子为昭容。二人同赐一宫，以示亲厚。
诸将感王妃豪情，誓除建成元吉。
七月初三，秦琼左武卫大将军，程知节右武卫大将军。尉迟敬德右武候大将军。
谏议大夫魏徵、王圭两人上表要求陪灵至葬地。太宗应，令原东宫齐王府幕僚属官皆同业。
杨氏女玉婉为德妃，赐宫室。
上深觉得然，遂召建成元吉见，道：“世民素不能饮，自今无得复夜饮！”
宫中哄传，高祖怒二妇**后内，暗害诸子。本欲昭告天下以车裂刀剐之刑杀之。然事关皇室，故纳太子妃长孙氏之言，着万贵妃宇文昭仪密除之，尸首弃于宫后。
次日，秦王妃长孙氏亲盛装入内，谢上恩，并献诸宝与尹张等人，谢其平常教诲之礼。又往万氏处，品茶胪陈当年情。万氏深感其贡献恭厚，乃进言于上曰：“众妇当中，唯此女可言端庄孝厚、才德具有也。当不欲之哀苦。”
武德七年（公元624年），元吉诞子，上携世民同幸其府。元吉私纳宇文宝于室，欲刺世民。建成阻，未果。然过后败迹，为长孙无忌知。世民忧。
建成归京，元吉着一侍卫遁辞世民党，告之此番事败，皆因世民。建成大怒，然终不允元吉杀世民之语。元吉大恨：“为兄计耳，于我何有？”
安葬那日，太宗在宜秋门大哭，悲哀难当。
且亲与皇后长孙氏并劳，亲以皇礼重葬。
……
武德九年八月初九甲子日（公元626年9月4日），太子李世民在东宫显德殿即天子位，是为唐太宗，并大赦天下。
世民退出。