开初，东厂只卖力侦缉、抓人，并没有审判犯人的权力，抓住的怀疑犯要交给锦衣卫北镇抚司审理；但到了明末，东厂也有了本身的监狱。
明朝大寺人王振、刘瑾、冯保、魏忠贤都曾统领东厂。到了明末，东厂也有了本身的监狱。
厂中建立最早、存在时候最长的东厂，设于永乐年间，全称东缉事厂，长官由司礼监寺人担负，被称为厂公或督主。朱棣以为，要完整断根建文帝的余党和其他反对权势，单靠锦衣卫的力量是不敷的。而如果赐与锦衣卫太重的权力，又怕对其难以节制。何况，锦衣卫设在宫廷以外，不如内廷寺人来得便利、用得放心。因而东厂便建立了，它的权威一开端就高于锦衣卫，用以监督和管束锦衣卫。
熟行厂又称内办事厂，设于武宗正德年间，仅存在了5年，由武宗宠幸的寺人刘瑾建立并亲领，用来伺察、监督东厂、西厂和锦衣卫。
《明史・刑法志》：“刑法有创自有明，不衷古制者，廷杖、东西厂、锦衣卫、镇抚司狱是已。是数者，杀人至惨，而不丽于法。踵而行之，至未造而极。举朝野命，一听之武夫、宦竖之手，良可叹也。”又“东厂之设，始于成祖。锦衣卫之狱，太祖尝用之，后已制止，其复用亦自永乐时。厂与卫相倚，故言者并称厂卫。”
西厂设于宪宗成化年间，职能与东厂不异，用来伺察、监督东厂和锦衣卫。它几经废立，前后凡六年，一度由宪宗的亲信寺人汪直统领。
锦衣卫，天子的侍卫机构。前身为太祖朱元璋时所设御用拱卫司。明洪武二年(1369年)改设大内亲军都督府，十五年设锦衣卫，作为天子侍卫的军事机构。
总的来讲，厂是由司礼监寺人统领的寺人机构，卫是由批示使统领的军事机构。而厂中的属官，如贴刑、缉事、隶役，则是从锦衣卫的官兵中调拨畴昔的。可见厂卫之间有着千丝万缕的联络，二者被视为明朝皇权的首要支柱，备受天子正视。
详细卖力侦缉事情的是役长和番役，役长相称于小队长，又叫“档头”，共有一百多人，也分子丑寅卯十二颗，一概戴尖帽，着白皮靴，穿褐色衣服，系小绦。役长各统帅番役数名，番役又叫“番子”，又叫“做事”，这些人也是由锦衣卫中遴选的精干分子构成。
东厂、西厂和锦衣卫是明朝在刑部、都察院、大理寺这三个司法构造以外设置的直接服从于天子，执掌“诏狱”的间谍机构。
锦衣卫的首级称为批示使（或批示同知、批示佥事），普通由天子的亲信武将担负，很少由寺人担负。属于外臣。而东厂、西厂的首级是寺人，即内臣。
东厂不但在机构及职员配置上更加精干公道，并且在侦缉行动上制定了相称周到的轨制。如每月月朔东厂都要集合安插当月的侦缉事情，厂役在东厂内抽签决定所卖力的地盘。在文献记录中能够发明，东厂厂役的事情种类都有特别的称呼。比方监督朝中各部官员会审大狱及锦衣卫拷讯罪犯者名为“听记”，在各到处所官府访缉者名为“坐记”，另有某位官员有何行动，或某城门捕得要犯，胥吏记录上报东厂者名为“打事件”。
在与锦衣卫的干系上，东厂厥后居上。因为东厂厂主与天子的干系密切，又身处皇宫大内，更轻易获得天子的信赖。锦衣卫向天子陈述要具疏上奏，东厂适口头中转；天子还付与东厂督主以监督锦衣卫职员的权力。东厂和锦衣卫的干系，逐步由平级变成了上下级干系。在寺人权倾朝野的年代，锦衣卫批示使见了东厂厂主乃至要下跪叩首。