石达开的部下开端悔怨误信其三寸不烂之舌，走上分裂线路的死路。杨辅清返回天京，仍然遭到重用，这给了他们很大鼓励，因而石达开的兵将开端大范围的出走：胡其相率多量精锐离开石达开，欲转入江西，却被湘军张运兰部截杀，无法投降，张运兰择胡其相部精干全数殛毙；杨再田与胡长佑、张运兰连日血战，不敌，遂离开石达开连夜遁逃；林彩新也率花旗军离开石达开；最为严峻的是，石军头号骁将石镇吉兄弟遭湘军围攻，伤亡惨痛，遂撤退至闽西南，自成一军，再不受石达开号令。
不到一个月，石达开在福建据点被清军一一断根，只余邵武孤城，四万雄师困于城中，上天无路，下地无门。
1858年，这一年石达开混得太差，厄运到临，他在浙江疆场遭受惨败，靠石镇吉等人拼力血战方幸运逃出浙江，达到福建又靠杨辅清打下的按照地才勉强居住。但石达开不但未存感激之情，反而因天王洪秀全的诽谤而妒恨石镇吉、杨辅清，意欲篡夺他们的兵权，导致杨辅清率部杀往江西，返回天京，石镇吉也心生了去意。
石达开对周天培甚为轻视，主动反击，成果为清军前锋杀败，全军惊骇，疾走数十里，石达开连杀部下数十人，承平军的崩溃仍不能止。次日，石达开再度构造反击，周天培率清军主力迎战，石达开又为所破，偏将数人被杀，清军攻至距石达开老巢十里处。