秋七月初二，吏部尚书孙丕扬要求批推举补缺官员的奏章，未予答复。十三日，仁圣皇太后驾崩。二旬日，开端调派中官在畿内开矿。不久，河南、山东、山西、浙江、陕西之矿皆获准开采，以中官统领。群臣多次进谏，皆未听取。
夏四月初三，李宗城从倭营跑回王京。
秋八月十一日，礼部侍郎张四维被升为礼部尚书兼任东阁大学士，参与秘密事件。十二日，黄河在高邮、砀山决口。二十三日，朝廷免除淮、扬、凤、徐等生水患之地的田租。
冬十月初三，京师再次地动，命群臣修身检验。初四，中断行刑。
十仲春初三，大学士赵志皋等人要求批留在宫禁中的奏章，未得答复。
这一年有乌斯藏前来朝贡。
玄月月朔，王家屏因父丧离职。二十四日，中断行刑。二十八日，朝廷下帑并派官吏施助河南、山东、直隶、陕西、辽东、淮、凤灾害。
冬十一月初三，湖广罹难，别离予以减免赋税和施助。
玄月二十三日，京师生地动。
■万历十七年(1589)春正月月朔，有日蚀。初九，太湖、宿、松一带有刘汝国等贼寇反叛，安庆批示陈越率兵讨伐，战死。
仲春十九日，吴松批示陈懋功讨伐并安定乱贼。
三月十六日，诏令表里官员保举将材。
夏四月月朔，日蚀，为日全食。初四，翊钧誊写谨天戒、任贤达、亲贤臣、远嬖佞、明奖惩、谨出入、慎起居、节饮食、收放心、存畏敬、纳忠告、节财用十二事置于座右边，以期自警。
■万历十三年(1585)春正月十九日，四川建武所兵变，击伤总兵沈思学。
玄月初六，施助荆州、承天及济南灾害。初九，四川都掌蛮被安定。二十六日，中断行刑。
玄月二十二日，又诏谕姑苏诸府开开荒田，六年以后起科。二十三日，中断行刑。
这一年，有安南、琉球、乌斯藏、土鲁番、天方、撒马儿罕、鲁迷、哈密前来朝贡。
秋七月，黄河在徐州决口。
■万历九年(1581)春正月初五，诏令边臣备警。初六，淘汰诸司冗员。初八，土蛮进犯锦州，游击周之望败死。十四日，朱翊钧诏命翰林官每天四人入阁供职。十六日，淘汰南京冗官。十九日，辽东总兵官李成梁在袄郎兔击败土蛮。
六月十九日，王锡爵归乡探亲。
这一年，有乌斯藏前来朝贡。
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闰十仲春二旬日，下诏免除第二年元夕灯火。
秋玄月初九，青海部长永邵卜进犯甘肃，参将达云将其击败。十六日，下诏规复建文年号。
八月初五，朱翊钧以灾异频繁为由，命表里诸臣修举实政。
十一月月朔，有日蚀。
冬十月十三日，中断行刑。二十二日，开端射中官专管通州专卖税收。而后，各省皆设税使。群臣屡谏不听。
这一年，京师生蝗灾，南畿、浙江生水患，朝廷别离予以施助和减免赋税。同年，琉球前来朝贡。
六月初十，禁令廷臣豪侈。当月，京师连降大雨，朝廷施助抚恤穷户百姓。
三月十八日，赐赉孙继皋等人进士落第以及其他分歧的出身。
蒲月十六日，下雨。
■万历十八年(159o)春正月月朔，朱翊钧召见大学士申时行等人于毓德宫，并引皇宗子前来相见。
夏四月十三日，施助湖广饥荒。
闰仲春十一日，俺答之子乞庆哈世袭顺义王封号。缅甸侵犯永昌。十二日，朱翊钧到天寿山进谒九陵，免除路过之地的田租。十七日，又到西山进谒恭让章皇后、景天子之陵。十八日回宫。乙酉日，施助临、巩、平、延、庆五府水灾，免除其田租。