■二年春正月甲午，召见朝觐廉能官于皇极门。
秋八月丙子，礼部侍郎张四维为礼部尚书兼东阁大学士，预机务。丁丑，河决高邮、砀山。戊子，免淮、扬、凤、徐被水田租。
夏四月乙丑，潮、惠贼平。庚午，旱，谕百官修省。
十一月丙子，诏度民田。
六月辛丑，慈宁宫成。壬寅，建武所乱卒伏法。是月，四川松、茂番反叛。
冬十一月辛未，湖广灾，蠲振有差。
■二十四年春仲春戊申，麻贵袭河套部，败之。
秋七月癸酉，免陕西逋赋。甲戌，副总兵祖承训帅师援朝鲜，与倭战于平壤，败绩。甲申，罢三边总督魏学曾，以叶兰梦代之，寻逮学曾下狱。
十仲春辛酉，振榆林、延绥饥。甲戌，以大行未期，罢来岁元夕灯火及宫中宴。
三月甲寅，礼部尚书马自强兼文渊阁大学士，吏部侍郎申时行兼东阁大学士，预机务。甲子，张居正葬父归。
玄月丙辰，以皇宗子生，诏赦天下。甲子，上两宫皇太后徽号。
是年，江北大水，淮溢，浸泗州祖陵。
■二十二年春正月己亥，诏以各省灾伤，山东、河南、徐、淮尤甚，盗贼四起，有司玩愒，朝廷诏令不可。自今以安民弭盗为抚按有司黜陟。
是年，琉球入贡。
十仲春乙亥，陈于陛卒。
十仲春甲申，遣廷臣九人阅边。
玄月己卯，起复张居正。
闰三月丁丑，以彗星见，敕修省。己卯，责给事中、御史传闻讪上，各夺俸一年。
■十年春仲春癸巳，顺义王俺答卒。丁酉，免天下积年逋赋。
蒲月戊辰，河套部敌犯甘肃，总兵官杨浚击破之。庚午，复议封倭，命都督佥事杨方亨、游击沈惟敬往。
夏四月癸酉，京师地动。
夏四月丁酉，振山西被灾州县。乙卯，振苏、松、淮、凤、徐、宿灾。户部进《万历管帐录》。
是年，安南、乌斯藏入贡。
六月乙卯朔，日有食之。甲子，即天子位。以来岁为万历元年，诏赦天下。祀建文朝尽节诸臣于乡，有苗裔者恤录。庚午，罢高拱。丁丑，高仪卒。壬午，礼部尚书吕调阳兼文渊阁大学士，预机务。
是年，琉球、乌斯藏入贡。
秋七月丙申，河套部长失兔犯延绥。是月，延绥总兵官麻贵败河套部敌于上马关。
闰玄月戊戌，振淮、凤灾。癸卯，如天寿山阅寿宫。戊申，还宫。庚申，停刑。
六月辛卯，核两畿、山东、陕西勋戚田赋。
玄月戊午，京师地动。
三月戊戌，以旱霾，谕廷臣陈时政。癸卯，禁部曹言事，罢治京畿水田。癸丑，赐唐文献等进士落第、出身有差。戊午，久旱，敕修省。
十一月戊子，郧阳兵噪，巡抚都御史李材罢。
秋七月癸未，谕廷臣，国事纷繁，致大臣争欲乞身，而后有肆行诽谤者重治。
三月丙辰，免升授官面谢。自是临御遂简。癸亥，云南永昌兵变。乙丑，赐焦竑等进士落第、出身有差。
八月庚申，以灾沴频繁，敕抚、按官惩贪吏，理冤狱，蠲租、振恤。
■二十年春正月丙戌，给事中孟养浩以言建储杖阙下，削籍。
闰仲春甲子，俺答子乞庆哈袭封顺义王。缅甸寇永昌。乙丑，如天寿山谒九陵，免所过田租。庚午，如西山谒恭让章皇后、景天子陵。辛未，还宫。乙酉，振临、巩、平、延、庆五府水灾，免田租。
三月丙寅，大阅。是月，土蛮犯辽阳，副总兵曹簠御之，败绩。
秋八月癸亥，河复决崔镇。闰月乙酉朔，日蚀，阴云不见。