东汉有郡国105个，除司隶所部七郡外，有王国27个，列郡71个。此中豫州部郡国6，冀州部9，兖州部8，徐州部5，并州部9，幽州部11，青州部6，荆州部7，扬州部6，益州部12，凉州部12，交州部9。
在县令、长之下，置县丞1人；县尉，大县2人，小县1人。丞主文书，典管仓狱，尉主盗贼，秩四百石至二百石，是为长吏。百石以下，有斗食佐史之秩，是为少吏。诸曹掾、史，大抵如郡掾。皆有主簿、功曹、狱掾，有县三老，掌教养。
西汉有郡都尉，比二千石，治郡兵，备盗贼，据《后汉书?百官志》载：“建武六年（公元30年），省诸郡都尉，並职太守。”东汉以郡都尉并于太守，可见东汉太守不但听郡政，並且典郡兵了。以是东汉的太守又称“郡将”。但在边郡常常置都尉或属都城尉，且有分县，掌治其民，比于小郡。如和帝永元元年（公元89年），置西河，上郡属都城尉。十五年（公元105年）又置辽东西部都尉。安帝以西羌数犯三辅，复置右扶风都尉、京兆虎牙都尉。
郡国之下为县，皇后、公主食邑为邑，在少数民族聚居之地为道（“道”在西汉已有）。大县置令1人，千石，其次置长，四百石，小者置长，三百石。侯国的相，其官阶如县令或县长，皆掌治其民，惩恶惩恶，理讼狱，禁盗贼。秋冬各计其户口垦田、钱谷出入、盗贼多少，然后向所属的郡国汇报。
《后汉书?宣秉传》云：光武特诏御史中丞（宣秉）与司隶校尉、尚书令会同並专席而坐，故京师号曰“三独坐”。
县邑道官
顺帝时，中常侍王甫、曹节弄权，太尉段颎谗附佞幸。当时阳球为司隶校尉，奏请收执王甫和段颎，送洛阳狱，阳球亲身拷问。王甫父子皆死杖下，段颎他杀。李膺当司隶校尉，中常侍张让之弟张朔为野王县令，贪残无道，枉杀妊妇，闻膺到任，藏于张让室第合柱中，李膺亲率处置破柱取朔，即杀之于洛阳狱。当此之时，诸黄门常侍休沐（假日），不敢擅出宫。桓帝问其故，皆说怕李校尉。司隶校尉能列席中心的“廷议”，並且他的坐位在九卿之上。
司隶校尉所部以外的十二州，建武十八年（公元42年）改州牧为刺史。刺史常以每年八月梭巡所部郡国，录囚徒，课殿最。西汉的刺史，本是中心调派的一种观察官，他们的任务是周行郡国，刺探政情，年关回京复奏，原非牢固的行政官吏。但到东汉时，刺史已有必然的治所和本身的衙门，每年遣吏向司徒府汇报。西汉旧制，州牧奏二千石长吏不称职者，皆先下三公，三公遣掾史案验，然后黜退。
司隶校尉属吏有处置史12人；都官处置，主察举百官犯法；功曹处置，主州部选署官吏及一应事件；别驾处置，凡校尉梭巡州部时，则奉引，并录众事；簿曹处置，主财谷簿书。如有军事，则置兵曹处置，掌兵事。别的，另有郡国处置，每郡国各1人，主催促文书，察举不法。皆由州自行辟除，通为百又有假左25人，主簿录中间事，省文书。门亭长掌州正门。门功曹书佐掌选用。《孝经》师主监试经。《月令》师主时节祠祀。律令师主平法律。簿曹书佐主簿书。每郡国各有典郡书佐1人，各主一郡文书，以郡吏补用，每年换一次。
亭之下为里，里置里魁，掌一里百家。里之下为什，什有什长，主十家事。什之下有伍，伍有伍长，主五家以相查察；民有善恶，以告监官。伍之下就是最基层的群众大众。