日本在白村江海战中固然蒙受了惨败，但是这并没有影响它与唐朝的来往，而唐朝也没有因为日本本来支撑百济国而对它冷淡，相反，两国的干系在海战以后变得更加密切。公元669年，日本派河内鲸为“平高丽道贺使”前去唐朝都城长安，庆祝大唐在朝鲜半岛的完整胜利。与此同时，日本开端主动选调派唐使，政治上生长与唐朝的睦邻干系，文明上主动汲取唐朝丰富的典章轨制，使得日本社会进入了一个全新的生长阶段。
在毁灭苏我氏中立下汗马功绩的中大兄皇子，并没有顺从皇极天皇的意义担当皇位，而是服从了中臣镰足的定见，推举本身的娘舅轻皇子担当皇位。公元645年6月14日，轻皇子即位，是为孝德天皇。孝德天皇即位后，建立了日本最早的年号“大化”，开端了以中大兄皇子为主导的改革，史称“大化改新”。
公元663年8月27日，唐朝水军与日本水军在海上遭受。从当时两边的兵力来看，大唐水军7000余人，战船170艘；日本水军有万余人，战船1000多艘。固然日甲士多、船多，但大唐水军船坚器利，兵器设备远胜于日军。
以现在的目光来看，产生在中日两国汗青上的第一次正面对决——白江村海战，对日本而言，有着没法消逝的主动意义，这场战事固然以日本得胜而宣布结束，但日本也从中熟谙到了本身与当时的唐朝所存在着的庞大差异，使其收敛了本身的傲气与野心，以谦虚的姿势全方位地向光辉光辉的中汉文明学习。而经此一战，唐朝不但给了日本以深切的经验，也更加稳固了在东亚文明圈的宗主职位。从这个角度来讲，这场战役没有输家。
公元645年6月12日，皇极天皇筹办在板盖宫大殿访问来自朝鲜半岛的使者，遵循以往天皇访问本国使者的常例，把持朝政的大贵族苏我入鹿必会参加。苏我氏自苏我稻目以来，擅权专政近百年，飞扬放肆，肃除异己，僭越皇权，横霸于世，而苏我入鹿，更是为人残暴，乃至逼迫圣德太子的儿子山背大兄皇子自刎。传说在山背大兄皇子死去的那一刻，天降祥云，光彩夺目，而当苏我入鹿昂首瞻仰时，天空却俄然变成了玄色。
苏我入鹿的倒行逆施引来了皇室成员和朝臣们的激烈不满，以皇极天皇宗子中大兄皇子和贵族中臣镰足为首的改革派决定撤除苏我入鹿。两人决定在皇极天皇访问外使时，刺杀苏我入鹿。中臣镰足向中大兄皇子保举了佐伯连子麻吕为刺客。
白村江海战得胜后，中大兄皇子深恐唐朝与新罗军队打击日本本土，因而从664年起，破钞巨资，前后修建了四道防地。特别是在九州的太宰府建的“水城”范围最大。所谓“水城”实际上是一座土坝，坝长1.2千米，底部宽80米，高十几米，外侧是一条5米深的水沟。除了在军事上采纳守势以外，667年，中大兄皇子还将都城迁往了近江大津宫。
公元663年6月，中大兄皇子号令上毛野冲弱带领2.7万人向新罗建议打击，篡夺了沙鼻歧，奴江二城，堵截了唐军与新罗的联络。不久，由孙仁师带领的7000名唐朝救兵渡海达到熊津，与刘仁轨会师，唐军军势是以大振。经诸将商讨以后，制定了打击周留的打算——刘仁愿和孙仁师以及新罗王金法敏率军从陆路打击；刘仁轨、杜爽则带领唐水军与新罗水军由熊津江入白村江口，溯江而上，从水长打击。
百济国被灭以后，原百济王扶余璋的部下福信及浮图道琛率众扼守周留城，抗击唐军。10月，福信调派使臣到日本，要求迎回在日本为人质的扶余丰王子，并向日本求援，以图复国。为了规复并扩大在朝鲜半岛上的影响，中大兄皇子同意了百济遗臣的要求，并于公元12月将都城从本地的飞鸟迁至本地的难波城。公元661年1月，监国的中大兄皇子在与百济隔海相望的盘濑设置了行宫。次年，日本向百济赠送多量物质，日本本土则“补葺兵甲、各具船舶、储设军粮”，随时筹办渡海作战。