丘处机为契机，在丘处机及其弟子们的鞭策下，全真道生长至鼎盛。当时全真道宫观遍及北方各省区，“虽十室之邑，必有一席之奉”。此鼎盛局面，自丘处机起，历经尹志平、李志常两任掌教，约莫三十年。至元宪宗五年（1255），佛道《化胡经》之争起，元室袒佛，全真道得胜。而后元室命令焚毁除《品德经》以外的统统道经，全真教蒙受沉重打击，全真道鼎盛局面因之结束。故在张志敬、王志坦、祁志诚、张志仙几任掌教中，处境都较困难。又经历约三十年，元成宗即位，驰焚经之禁，全真道获得普通生长。元世祖至元十三年（1276）安定江南，天下同一。而后，原同源异流而分传于金与南宋的全真道和玄门南宗，逐步认同、融会，至元朝中前期，二宗归并的前提渐趋成熟。在南宗羽士陈致虚等人的鞭策下，二宗颠末对祖师宗祀的调剂，南宗最后并入全真道。归并后的全真道遂成为更大的道派，而与正一道分统天下玄门。明朝皇室对佛、道采纳按捺、束缚政策，对道指正一派有所信奉，对全真道支撑较少，全真道自此进和式微期间。金元期间构成的同一带领核心（以北京白云观为基地）蓦地崩溃。在此情势下，同一的全真道渐次分化成诸多小支派。首要的有“七真派”，即宗祖马钰的遇仙派，宗祖谭处端的南无派，宗祖刘处玄的随山派，宗祖丘处机的龙门派，宗祖王处一的嵛山派，宗祖郝大通的华山派，宗祖孙不二的平静派等。别的，又有一些全真羽士别离构成“五祖派”，即宗祖王玄甫的少阳派，宗祖钟离权的正阳派，宗祖吕洞宾的纯阳派，宗祖刘海蟾的刘祖派，宗祖王囗的重阳派。如此浩繁的全真支派呈现，并不表示全真道的畅旺发财，刚好反应它的式微。它们的构成时候，最早在明朝中前期，多数在明后。在明清玄门式微期间，只要龙门派因王常月的阐扬，曾经在清月朔度“复兴”，其他各派，多数式微不振。