甲寅，以冀州牧窦融为大司空。融自以非旧臣，一旦入朝，在功臣之右，每召会进见，面貌辞气，卑恭已甚，帝以此愈亲厚之。融谨慎，久不自安，数辞爵位，上疏曰：“臣融有子，朝夕教诲以经艺，不令观天文，见谶记，诚欲令恭肃畏事，恂恂守道，不肯其有才气，何况乃当传以连城广土，享故诸侯王国哉！”因复请间求见，帝不准。后朝罢，逡巡席后，帝知欲有让，遂使摆布传出。它日会晤，迎诏融曰：“日者知公欲让职还土，故命公暑热且自便。今相见，宜论它事，勿得复言。”融不敢重陈请。
太中大夫梁统上疏曰：“臣窃见元帝初元五年，轻决极刑三十四事，哀帝建平元年，轻决极刑八十一事；其四十二事手杀人者，减死一等。自是今后，著为常准，故交轻犯法，吏易杀人。臣闻立君之道，仁义为主，仁者爱人，义者正理。爱人以除残为务，正理以去乱为心；科罚在衷，无取于轻。高帝受命，约令定律，诚得其宜，文帝唯除省肉刑、相坐之法，自馀皆率由旧章。至哀、平继体，即位日浅，听断尚寡。丞相王嘉轻为穿凿，亏除先帝旧约成律，数年之间百有馀事，或不便于理，或不厌民气，谨表其尤害于体者，傅奏于左。愿陛下宣诏有司，详择其善，定不易之典。”事下公卿。光禄勋杜林奏曰：“大汉初兴，蠲除苛政，海内欢乐；及至厥后，渐以滋章。果桃菜茹之馈，集以成赃，小事无妨于义，觉得大戮。至于法不能禁，令不能止，高低相遁，为敝弥深。臣愚觉得好如旧制，分歧翻移。”统复上言曰：“臣之所奏，非曰酷刑。《经》曰：‘爰制百姓，于刑之衷。’衷之为言，不轻不重之谓也。自高祖至于孝宣，海内称治，至初元、建平而盗贼浸多，皆科罚不衷，愚人易犯之而至也。由此观之，则刑轻之作，反生大患，惠加奸轨，而害及良善也！”事寝，不报。
初，王莽以广汉文齐为益州太守，齐训农治兵，降集群夷，甚得其和。公孙述时，齐恪守拒险，述拘其老婆，许以封侯，齐不降。闻上即位，间道遣使自闻。蜀平，征为镇远将军，封成义侯。
仲春，遣捕虏将军马武屯虖沱河以备匈奴。
夏，四月，丁巳，封皇子辅为右翊公，英为楚公，阳为东海公，康为济南公，苍为东平公，延为淮阳公，荆为山阳公，衡为临淮公，焉为左翊公，京为琅邪公。癸丑，追谥兄縯为齐武公，兄仲为鲁哀公。帝感縯功业不就，抚养二子章、兴，恩爱甚笃。以其少贵，欲令亲吏事，使章试守平阴令，兴缑氏令。厥后章迁梁郡太守，兴迁弘农太守。
丙子，行大司空马成复为扬武将军。
李通欲避权势，乞骸骨；积二岁，帝乃听上大司空印绶，以特进奉朝请。后有司奏封皇子，帝感通初创大谋，本日，封通少子雄为召陵侯。
建武十五年己亥，公元三九年春，正月，辛丑，大司徒韩歆免。歆好直言，无忌讳，帝每不能容。歆于上前证岁将饥凶，指天画地，言甚刚切，故坐免归田里。帝犹不释，复遣使宣诏责之；歆及子婴皆他杀。歆素有重名，死非其罪，浩繁不厌；帝乃追赐钱谷，以成礼葬之。
卢芳攻云中，久不下。其将随昱留守九原，欲胁芳来降；芳知之，与十馀骑亡入匈奴，其众尽归随昱，昱乃诣阙降。诏拜昱五原太守，封镌胡侯。
益州传送公孙述瞽师、郊庙乐器、葆车、舆辇，因而法物始备。时兵革既息，天下少事，文书调役，务从简寡，至乃十存一焉。
卢芳与匈奴、乌桓连兵，数寇边。帝遣骠骑大将军杜茂等将兵镇守北边，治飞狐道，筑亭障，修烽燧，凡与匈奴、乌桓大小数十百战，终不能克。