同月，天子束发，归长安。太祖既至长安，群丑慑伏，王允联诸逆相约谋太祖，重申旧誓。未几，与会者八人，出首者四也。
如题所示，新版本的旧燕书，出自阿备。
太祖既破张宝，复以社稷重，自请提三千骑，以驰河北。灵帝许之，乃诏太祖入洛。太祖乃集幽燕骑三千，直趣南下。至洛，拜五官中郎将，以骑都尉曹操辅之，持节驻河内，并督三河五校。旬日出东郡，即破白马、燕县、韦乡。太祖既伐黄巾至东郡，闻济阴有士名李进者，素知诗书，乃殚夜而往辟之。李进感其德厚，逢太祖克城发愤，乃慨然举族而助。
同月，汉帝与表、备会于西陵。备乃自请出南阳。
将归，路见流民纷落，甚不忍，遂止行，引众安于昌平道口，亲耕枣栗于燕山以哺民，兼阻绝胡路。凡数年，来往投者百万计。或谓：“燕武之德，自此始也。”
同月，韩当围鄾聚，获备首。
汉建安初，田楷往长安谒太祖，楷者，太祖少年故交也，太祖大喜，加骑都尉，并邀住卫将军府，同塌而眠，登堂拜母。楷初谨慎，渐松，遂阔略无高低礼，与太祖言，至于呼字。庞德为义从长，怒，请杀之，太祖不从，曰：“公直固少年故交也，村夫旧友，同郡为吏，何至于此？”德出，与张既、京泽等言，泽曰：“当示之以威礼。”明日，太祖于明光宫大会三辅诸将、官吏，论及河北战事。楷本无召，既虚言邀入，及入光亮宫，见公卿无数，俱肃容列坐，庞德引义参军，京泽引虎贲军，并披挂环列宫表里，而楷之位居于边角。楷遂大惊，乃知太祖宽宏，自后益尊事谨慎。
设三省，一设中书省，掌秘密，发政令，为辅弼领；再设尚书省，掌秘密，统揽各部、台、曹、阁所入文书，批陈阅览，为左相领；后设门下省，掌秘密，专司监察、批驳政令，为右相领。三省之下，复设六部，曰礼部、吏部、工部、兵部、刑部、户部，每部皆有尚书一人，摆布侍郎二人，直对各州郡县乡亭；又设十二寺，还是属三省，曰太常寺、鸿胪寺、宗正寺、大理寺、少府寺、太仆寺、司农寺、将作寺、黄阁寺、版印寺、钦天寺、卫尉寺。再设四台，曰御史台、财务台、枢密台、靖安台，御史台掌监察，为钜鹿田丰领，财务台掌财务，为北海王修所领，枢密台掌兵马调剂，为辽西韩当所领，靖安台权责不明，但以颍川戏忠所领，郭嘉为副。又曰，凡三省三相，与四台领袖，并于邺下铜雀台设坐，并称台僚，遇非常事，七座并论，可决国事！
同月，汉中太守张鲁孤身出斜道，降之。乃令赵云进驻汉中，都督汉中、武都二郡，又发杨秋引千骑为辅，然使鲁为汉中太守。汉中遂定。
汉建安二年，元月，太祖提数千众进清河，许攸以五万众设伏之，困之。当是时也，太宗仁天子年十二，亦在军中，太祖乃置太宗于膝上，故批示若定，不为所乱，谓太宗曰：“且观诸长辈破贼！”众感而奋，遂破之。
汉建安七年，春，太祖进两淮。发镇西将军公孙越、益州牧田丰、冠军将军赵云、汉中太守郭嘉伐蜀。
同月，吴郡降。
熹闰年底，郡中骤遇鲜卑万骑侵入，于柳城虏郡守母，载以叩郡治阳乐。太祖临卢龙，又汇兵数千，当有所为也。然辽西广漠，自卢龙出柳城三百里，出阳乐五百里，所虑尤无能也。时娄圭在侧，献奇计，欲以太祖切身犯险，摆布皆怒，拔刀示刃者数矣。太祖乃排众曰：“子伯者，弃家来投，千里相随，吾视之为股肱，安可疑乎？”遂行。遂与公孙范、程普、韩当、娄圭潜至鲜卑营。