开元元年，太祖受禅登极，普受封万户，领司州牧。
后太祖将至洛，忧鲜卑为祸桑梓，以普慎重，表为雁门都尉。鲜卑轲比能部袭扰幽并，为普所退。汉中平六年前泰山太守张举举族背叛，勾搭鲜卑、乌桓，破卢龙塞，莫敢当者，普率军与战，三战皆胜，纯败逃塞外。七月，董卓为祸，普以建威将军领辽西太守应太祖檄文往盟，太祖以方面任之，曰：“前，吾与诸将共往，后，有德谋无忧”。
建安六年，官渡战起，太祖以普为前营批示，普连营三十里叠叠向前。操因前战倒霉，欲夺先声，数与普战，无果，束手无策，乃令人骂曰：“普数战无功，此一将无能，累死全军也。”军中闻之皆请战，普闻之，虽忿，旧岿然不动。后有军吏复告太祖，太祖拊掌曰：“岂不闻，善战者无赫赫之功乎，德谋可托大事。”军中遂安。玄月，战机至，普领兵向前，所向皆破，操弃营而走。
建安五年秋，太祖伐凉，以云为前锋，出散关，扼武都道，时有氐王杨千万等七八部，受韩遂命，各拥众万余锁武山、氐道，隔断陇西，道险狭处，步径裁通，贼等壁其上。云本欲弃之北归汉阳，闻太祖已至懦夫，迫韩遂于榆中，乃复西行观其地理，归告程银曰：‘贼众虽众，且塞武山狄道，然各不统属，互难援助，可破也！’银与诸将皆曰：“此言或是也，然兵少道险，虽胜一二，难用深切，恐难尽破！”云对曰：“此所谓一与一，卫将军所言狭路相逢勇者胜耳，破其二三，其众自溃。”遂进到武山下安营，全军六千，仰攻之，斩杨千万与一氐王首，未至其三，贼尽溃而走。遂通武山至陇西。陇西空虚，云复以银引众守鄣县，自选精骑八百，亲逆洮水北行出狄道。至黄河，方立寨，逢韩遂弃榆中西行至此，众七千不止，云乃使摆布偃旗藏于寨中，单骑横槊立旗于营前。遂眺望之见旗号营盘，大恐至泣，乃东归降太祖。太祖闻之，叹曰：“子龙一身是胆！”以平凉第一，加冠军将军，赠秩。
汉光和七年，广阳黄巾三万围涿城，太祖为涿郡守，见敌至城下立寨，乃引公孙越、刘备、关羽、牵招、张飞、魏越凡二十骑出城，透贼寨而还，贼不能伤也。及入城门中，众将自矜夸斩获不止，唯羽不言，太祖问之，答曰：“观彼辈形状多闾左氓首，不能救彼，罪也，故不敢夸功，但求速平此乱也。”太祖壮其志，任其假曲军侯，领新募之军。及程远志军败，太祖驱败兵打击张宝大营，远志聚众返身故战，为羽所斩，贼复溃，遂夺黄巾营盘。蒲月羽克发干县城，束缚军士，张榜安民。时县内游侠潘璋，字文珪，性博荡恶棍，素无形状，其年十六，于城中见羽威风，乃大叹之，往投，自变行动善，遂成健将，专司扛刀，后致位将军。十月黄巾平，羽因斩将拔城之功迁河内朝歌令。
关羽，本字长生，后太祖赐字云长，河东解人也。少为朋友仇，逃亡奔赵国，路乏资财，守节不为盗，闻太祖筑堤于圪芦河，遂输石于堤。光和二年底，霞堤将成，刺史刘焉往视，遇刺，为吕布与羽救。时太祖再侧，见而奇之，后闻其旧事，遂引为腹心。摆布以逃人相讽，太祖笑而对曰：“今海内沸腾，当用贤者，焉以戋戋而不消？”
飞善乱战，爱敬君子而不恤小人。建安八年，太祖以吕范为帅，与刘备战于淯水，备，飞之义兄也，飞受命将兵两千往攻吕范，及战，飞独率亲卫奋勇向前，斩四将，擒一将，连透数营，然其部遭阻，飞不顾，及至司马懿营前，单骑往刺懿，懿部不能当，懿马惊而走，飞逐之于阵，忽懿马失前蹄，自忖必死，然飞以其出身王谢，恕之，单骑东走，满营皆不敢阻。及刘备复至，情势愈危。懿羞愤不免，遂卸甲割髻，裸衣号令军前，亲突阵向南扑备中军，乃大胜。待全军往逐刘备，独懿寻飞不止，并得飞洗甲于淯水中。二者一时皆裸衣，激斗于淯水，飞前突阵负创七处，渐不支，为懿杀之于水。唯岸流狠恶，竟不得尸。”