甲寅，上行幸长安；三月，幸蒲坂，祠后土。
建武十九年癸卯，公元四三年春，正月，庚子，追尊宣帝曰中宗。始祠昭帝、元帝于太庙，成帝、哀帝、平帝于长安，舂陵节侯以下于章陵；其长安、章陵，皆太守、令、长侍祠。
吴汉发广汉、巴、蜀三郡兵，围成都百馀日，秋，七月，拔之，斩史歆等。汉乃乘桴沿江下巴郡，杨伟等惶恐闭幕。汉诛其渠帅，徙其党与数百家于南郡、长沙而还。
建武十八年壬寅，公元四二年仲春，蜀郡守将史歆反，攻太守张穆，穆逾城走；宕渠杨伟等起兵以应歆。帝遣吴汉等将万馀人讨之。
马援进击征侧馀党都阳等，至居风，降之；峤南悉平。援与越人申明旧制以束缚之，自后骆越推行马将军故事。
妖贼单臣、傅镇等相聚入原武城，自称将军。诏太中大夫臧宫将兵围之，数攻不下，士卒死伤。帝召公卿、诸侯王问方略，皆曰：“宜重其购赏。”东海王阳独曰：“妖巫相劫，势无久立，此中必有悔欲亡者，但核心急，不得走耳。宜小挺缓，令得流亡，流亡，则一亭长足以禽矣。”帝然之，即敕宫彻围缓贼，贼众分离。夏四月，拔原武，斩臣、镇等。
建武十七年辛丑，公元四一年春，正月，赵孝公良薨。初，怀县大姓李子春二孙杀人，怀令赵熹穷治其奸，二孙他杀，收系子春。京师贵戚为请者数十，熹终不听。及良病，上临视之，问所欲言，良曰：“素与李子春厚，今犯法，怀令赵熹欲杀之，愿乞其命。”帝曰：“吏奉法律，不成枉也。更道它所欲。”良无复言。既薨，上追思良，乃贳出子春。迁熹为平原太守。仲春，乙未晦，日有食之。
郭后宠衰，数抱恨怼，上怒之。冬，十月，辛巳，废皇后郭氏，立朱紫阴氏为皇后。诏曰：“非常之事，非国休福，不得上寿称庆。”郅惲言于帝曰：“臣闻佳耦之好，父不能得之于子，况臣能得之于君乎！是臣所不敢言。固然，愿陛下念其可否之计，无令天下有议社稷罢了。”帝曰：“惲善恕己量主，知我必不有所摆布而轻天下也！”帝进郭后子右翊公辅为中山王，以常山郡益中山国，郭后为中山太后，其馀九国公皆为王。
马援斩征侧、征贰。
戊申，上行幸河内；戊子，还宫。
匈奴、鲜卑、赤山乌桓数连兵入塞，杀略吏民；诏拜襄贲令祭肜为辽东太守。肜有勇力，虏每犯塞，常为士卒锋，数破走之。肜，遵之从弟也。
安平侯盖延薨。
是岁，莎车王贤复遣使奉献，请都护；帝赐贤西域都护印绶及车旗、黄金、斑斓。敦煌太守裴遵上言：“蛮夷不成假以大权；又令诸国绝望。”圣旨收还都护印绶，更赐贤以汉大将军印绶；其使不肯易，遵迫夺之。贤由是始恨，而犹诈称多数护，移书诸国，诸国悉服属焉。
十仲春，庚午，以关内侯戴涉为大司徒。卢芳自匈奴复入居高柳。是岁，骠骑大将军杜茂坐使军吏杀人，免。使扬武将军马成代茂，缮治障塞，十里一候，以备匈奴。使骑都尉张堪领杜茂营，击破匈奴于高柳。拜堪渔阳太守。堪视事八年，匈奴不敢犯塞，劝民耕稼，乃至殷富。百姓歌曰：“桑无附枝，麦穗两歧。张君为政，乐不成支！”
是岁，罢州牧，置刺史。
卢芳入朝，南及昌平，有诏止，令更朝明岁。
卢芳与闵堪使使请降，帝立芳为代王，堪为代相，赐缯二万匹，因使和集匈奴。芳上疏谢，自陈思望阙庭；诏报芳朝来岁正月。初，匈奴闻汉购求芳，贪得财帛，故遣芳还降。既而芳以自归为功，不称匈奴所遣，单于复耻言其计，故赏遂不可。由是大恨，犯境尤深。