南单于师子死，单于长之子檀立，为万氏尸逐韑单于。
玄月，戊午，太尉张醫免。丙寅，以大司农张禹为太尉。
秋，七月，辛亥朔，日有食之。
永元十一年己亥，公元九九年夏，四月，丙寅，赦天下。
巫蛮许圣以郡收税不均，痛恨，遂反；辛卯，寇南郡。
三月，戊辰，临辟雍飨射，赦天下。
是岁，初令郡国以日北至按薄刑。
夏，四月，遣使者督荆州兵万馀人，分道讨巫蛮许圣等，大破之。圣等乞降，悉徙置江夏。
岭南旧献生龙眼、荔枝，十里一置，五里一候，日夜传送。临武长汝南唐羌上书曰：“臣闻上不以滋味为德，下不以贡膳为功。伏见交趾七郡献生龙眼等，鸟惊风发；南州地盘酷热，恶虫猛兽，不断于路，至于冒犯灭亡之害。死者不成复活，来者犹可救也。此二物升殿，一定延年益寿。”帝下诏曰：“远国珍羞，本以荐奉宗庙，苟有伤害，岂爱民之本，其敕太官勿复受献！”
冬，十月，戊申，帝幸章陵；戊午，进幸云梦。时太尉张禹留守，闻车驾当幸江陵，觉得不宜冒险远游，驿顿时谏。诏报曰：“祠谒既讫，当南礼大江；会得君奏，临汉回舆而旋。”十一月，甲申，还宫。
秋，七月，己巳，司空韩棱薨。八月，丙子，以太常太山巢堪为司空。
永元十五年癸卯，公元一零三年夏，四月，甲子晦，日有食之。时帝遵肃宗故事，兄弟皆留京师，有司以日蚀阴盛，奏遣诸王就国。诏曰：“甲子之异，责由一人。诸王老练，早离顾复，弱冠相育，常有《蓼莪》、《凯风》之哀。选儒之恩，知非国典，且复宿留。”
十一月，癸卯，以光禄勋河南吕盖为司徒。
永元十年戊戌，公元九八年夏，蒲月，京师大水。