姑臧大饥，米斗直钱五千，人相食，饥死者十馀万口。城门昼闭，樵采路绝，民请出城为胡虏奴婢者，日稀有百，吕隆恶其沮动众心，尽坑之，积尸盈路。沮渠蒙逊引兵攻姑臧，隆遣使求救于河西王利鹿孤，利鹿孤遣广武公傉檀帅骑一万救之，未至，隆击破蒙逊军，蒙逊请与隆盟，留谷万馀斛遣之而还。傉檀至昌松，闻蒙逊已退，乃徙泽段冢民五百馀户而还。
东土遭孙恩之乱，因以饥荒，漕运不继。桓玄禁断江路，商旅俱绝，公私匮乏，以粰、橡给士卒。玄谓朝廷方多忧虞，必未暇讨己，能够蓄力观衅。及雄师将发，从兄太傅长史石生密以书报之。玄大惊，欲完聚保江陵。长史卞范之曰：“明公英威振于远近，元显口尚乳臭，刘牢之大失物情，若兵邻近畿，示以祸福，土崩之势可翘足而待，何有延敌出境，自取穷蹙者乎！”玄从之，留桓伟守江陵，抗表传檄，罪行元显，举兵东下。檄至，元显大惧。仲春，丙午，帝饯元显于西池，元显下船而不发。
玄自谓有晋国三分之二，数令人上己符瑞，欲以惑众；又致笺于会稽霸道子曰：“贼造近郊，以风不得进，以雨不致火，食尽故去耳，非力屈也。昔国宝身后，王恭不乘此威入统朝政，足见其心非侮于明公也，而谓之不忠。今之贵要腹心，偶然流清望者谁乎？岂可云无佳胜！直是不能信之耳！尔来一朝一夕，遂成本日之祸。在朝君子皆畏祸不言，玄忝任在远，是以披写究竟。”元显见之，大惧。
牢之军溧洲，参军刘裕请击玄，牢之不准。玄使牢之族舅何穆说牢之曰：“自古戴震主之威，挟不赏之功而能自全者，谁邪？越之文种，秦之白起，汉之韩信，皆事明主，为之极力，功成之日，犹不免诛夷，况为凶愚者之用乎！君如本日克服则倾宗，败北则覆族，欲以此安归乎！不若幡然改图，则能够长保繁华矣。前人射钩、斩祛，犹不害为帮手，况玄与君无宿昔之怨乎！”时谯王尚之已败，情面愈恐，牢之颇纳穆言，与玄交通。东海中尉东海何无忌，牢之之甥也，与刘裕极谏，不听。其子骠骑处置中郎敬宣谏曰：“今国度衰危，天下之重在大人与玄。玄藉父、叔之资，占有全楚，割晋国三分之二，一朝纵之使陵朝廷，玄声望既成，恐难图也，董卓之变，将在今矣。”牢之怒曰：“吾岂不知！本日取玄如反覆手耳；但平玄以后，令我奈骠骑何！”三月，乙巳朔，牢之遣敬宣诣玄请降。玄阴欲诛牢之，乃与敬宣宴饮，陈名书画共观之，以安悦其意；敬宣不之觉，玄佐吏莫不相视而笔。玄板敬宣为咨议参军。
桓玄发江陵，虑事不捷，常为西还之计。及过寻阳，不见官军，意甚喜，将士之气亦振。庾楷谋泄，玄囚之。丁巳，诏遣齐王柔之以驺虞幡宣布荆、江二州，使罢兵；玄前锋杀之。柔之，宗之子也。
张法顺谓元显曰：“桓玄承籍世资，素有豪气，既并殷、扬，专有荆楚，第下之所控引止三吴耳。孙恩为乱，东土涂地，公私困竭，玄必乘此纵其奸凶，窃用忧之。”元显曰：“为之何如？”法顺曰：“玄始得荆州，情面未附。方务绥抚，未暇他图。若乘此际使刘牢之为前锋，而第下以雄师继进，玄可取也。”元显觉得然。会武昌太守庾楷以玄与朝廷成仇，恐事不成，祸及于己，密令人自结于元显，云：“玄大失情面，众不为用，若朝廷遣军，己当为内应。”元显大喜，遣张法顺至京口，谋于刘牢之；牢之以难堪。法顺还，谓元显曰：“观牢之言色，必贰于我，不如召入杀之；不尔，败人大事。”元显不从。因而大治水军，征兵装舰，以谋讨玄。