玄挟帝单舸西走，留永安何皇后及王皇后于巴陵。殷仲文时在玄舰，求出别船汇集散卒，因叛玄，奉二后奔夏口，遂还建康。
十仲春，刘毅等进克巴陵。毅号令严整，所过百姓安悦。刘裕复以毅为兖州刺史。桓振以桓放之为益州刺史，屯西陵；文处茂击破之，放之走还江陵。
癸巳，谦等帅群臣奉玺绶于帝曰：“主上法尧禅舜，今楚祚不终，百姓之心复归于晋矣。”以琅邪王德文领徐州刺史，振为都督八州诸军事、荆州刺史，谦复为侍中、卫将军，加江、豫二州刺史，帝侍御摆布，皆振亲信也。
刘容领青州刺史。刘敬宣在寻阳，聚粮缮船，何尝无备，故何无忌等虽败退，赖以复振。桓玄兄子亮自称江州刺史，寇豫章，敬宣击破之。
西凉世子谭卒。
戊辰，魏主珪如豺山宫。
燕王熙与苻后游畋，北登白鹿山，东逾青岭，南临沧海而还，士卒为虎狼所杀及冻死者五千馀人。
毅等既克服，觉得大事已定，不急追蹑，又遇风，船未能进，玄死几一旬，诸军犹未至。时桓谦匿于沮中，扬武将军醒振匿于华容浦，玄故将王稚徽戍巴陵，遣人报振云“桓歆已克京邑，冯稚复克寻阳，刘毅诸军并中路败退。”振大喜，聚党得二百人，袭江陵，桓谦亦聚众应之。闰月，己丑，复陷江陵，杀王康产、王腾之。振见帝于行宫，跃马奋戈，直至阶下，问桓昻地点。闻其已死，横眉谓帝曰：“臣流派何负国度，而屠灭如果！”“琅邪王德文下床谓曰：此岂我兄弟意邪！振欲杀帝，谦苦禁之，乃上马，敛容致拜而出。壬辰，振为玄举哀，立丧庭，谥曰武悼天子。”
燕王熙于友腾苑起清闲宫，连房数百，凿曲光海，隆冬，士卒不得歇息，□曷死者大半。
是岁，晋民避乱，襁负之淮北者门路相属。
玄使武卫将军庾稚祖、江夏太守桓道恭帅数千人就何澹之等共守湓口。何无忌、刘道规至桑落洲，庚戌，澹之等引舟师逆战。澹之常所乘舫羽仪旗号甚盛，无忌曰：“贼帅必不居此，欲诈我耳，宜亟攻之。”众曰：“澹之不在此中，得之无益。”无忌曰：“今众寡不敌，战无全胜，澹之既不居此舫，兵士必弱，我以劲兵攻之，必得之；得之，则彼势沮而我气倍，因此薄之，破贼必矣。”道规曰：“善！”遂往攻而得之，因传呼曰：“已得何澹之矣”。澹之军中惊扰。无忌之众亦觉得然，乘胜打击澹之等，大破之。无忌等克湓口，进据寻阳，遣使馈送宗庙主祏还京师。加刘裕都督江州诸军事。
辛巳，荆州别驾王康产奉帝入南郡府舍，太守王腾之帅文武为侍卫。
八月，癸酉，葬穆章皇后于永平陵。
辛巳，魏大赦，改元天赐。筑西宫。十一月，魏主珪如西宫，命宗室置宗师，八国置大师、小师，州郡亦各置师，以辨宗党，举才行，如魏、晋中正之职。
玄月，刁骋谋反，伏法，刁氏遂亡。刁氏素富，奴客纵横，专固山泽，为京口之患。刘裕散其资蓄，令民称力而取之，弥日不尽。时州郡饥弊，民赖之以济。
振少薄行，玄不以子妷齿之。至是，叹曰：“公昔不早用我，遂致此败。若使公在，我为前锋，天下不敷定也。今独作此，安归乎？”遂纵意酒色，肆行诛杀。谦劝振引兵下战，己守江陵，振素轻谦，不从其言。
柔然可汗社仑从弟悦代大那行刺社仑，不克，奔魏。
卢循寇南海，攻番禺。广州刺史濮阳吴隐之把守百馀日。冬，十月，壬戌，循夜袭城而陷之，烧府舍、民室俱尽，执吴隐之。循自称平南将军，摄广州事。聚烧骨为共冢，葬于洲上，得髑髅三万馀枚。又使徐道覆攻始兴，执始兴相阮腆之。